CEBPD对气道平滑肌糖皮质激素反应的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE146017

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

CCAAT/增强子结合蛋白D（CEBPD）是一种转录因子，调控参与免疫和炎症反应的基因。基于我们此前的观察——即糖皮质激素暴露可增加气道平滑肌（ASM）中CEBPD的表达，我们通过敲低实验试图进一步了解其在ASM对糖皮质激素转录组反应中的作用。来自四名非哮喘供者的原代人气道平滑肌（ASM）细胞使用RNAiMax转染25pmol的非靶向对照siRNA或siCEBPD SMARTpool。转染三天后，细胞分别用100nM布地奈德、10ng/ml TNF-α或两者联合处理18小时。使用Kapa mRNA HyperPrep Illumina文库试剂盒制备RNA-Seq文库。使用Illumina HiSeq 2500仪器生成125碱基对的双端读长。使用STAR将测序读长比对至hg38参考基因组，并使用HTSeq定量转录本水平。使用DESeq2进行差异表达分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。