BAMSE和INMA队列中哮喘、皮炎和鼻炎多病共患的全血基因表达特征

该数据集来自NCBI GEO,标题为BAMSE和INMA队列中哮喘、皮炎和鼻炎多病共患的全血基因表达特征。数据可用于研究哮喘、皮炎和鼻炎多病共患相关的全血基因表达特征(来源 NCBI)

geo
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基因组分类Expression profiling by arrayGPL175869606
GSE141661: A novel whole blood gene expression signature for asthma, dermatitis and rhinitis multimorbidity in BAMSE and INMA cohort

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

BAMSE和INMA队列中哮喘、皮炎和鼻炎多病共患的全血基因表达特征

GSE141661 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达数据集,标题为“A novel whole blood gene expression signature for asthma, dermatitis and rhinitis multimorbidity in BAMSE and INMA cohort”,即 BAMSE 和 INMA 队列中哮喘、皮炎和鼻炎多病共患的全血基因表达特征研究。该数据集属于呼吸系统疾病 / 哮喘分类,采用芯片表达谱技术,主题标签涉及 Expression profiling by array、GPL17586 平台和 9606(人类)。数据集由作者 Nathanaël Lemonnier 发布,发布时间为 Dec 09 201,包含 1 个文件,样例文件为 GSE141661_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集面向哮喘、皮炎和鼻炎多病共患的全血基因表达特征研究,可为相关领域的表达谱分析提供数据基础。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI GEO,源站标题为“A novel whole blood gene expression signature for asthma, dermatitis and rhinitis multimorbidity in BAMSE and INMA cohort”。从标题可以看出,该研究关注 BAMSE 和 INMA 两个队列中哮喘、皮炎和鼻炎多病共患(multimorbidity)情况下的全血基因表达特征。数据集所属分类为呼吸系统疾病 / 哮喘,主题标签包括 Expression profiling by array、GPL17586 和 9606,表明其采用芯片表达谱技术,面向人类样本。源站描述指出,该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,说明该数据集在 GEO 中属于一个整合多个子系列的超系列记录。

【数据内容】

该数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE141661_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包格式,属于 GEO 系列矩阵文件,通常用于承载样本层面的表达谱矩阵信息。数据集主题标签中的 GPL17586 指向所使用的芯片平台,9606 指向人类物种。数据内容围绕全血基因表达特征展开,可用于研究哮喘、皮炎和鼻炎多病共患相关的表达模式。除上述文件信息外,源站未提供更详细的样本数量、分组构成或基因数量等具体内容。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI GEO 公共数据库。数据集作者为 Nathanaël Lemonnier,发布时间为 Dec 09 201。源站描述说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,但具体子系列信息未在已有信息中展开。样本来源涉及 BAMSE 和 INMA 队列,研究材料为全血,检测方式为芯片表达谱(Expression profiling by array)。关于队列招募细节、样本采集流程和伦理审批等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于研究哮喘、皮炎和鼻炎多病共患相关的全血基因表达特征,适合开展表达谱层面的探索性分析,例如比较不同疾病共患状态下的基因表达模式、识别候选表达特征等。由于主题标签涉及 Expression profiling by array 和人类物种,也可用于芯片表达谱数据的整合分析或方法学验证。具体适用场景应结合数据实际样本构成和分析设计确定,源站未提供更细化的应用说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE141661_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因文件结构或编码问题导致分析偏差。读取后可根据系列矩阵文件中的样本信息和表达值开展后续分析。关于具体的预处理步骤、归一化方法和分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 GEO 公共数据,包含 1 个系列矩阵文件,文件数量较少,具体样本量、分组平衡性和数据完整性等信息源站未提供。由于源站描述仅说明该 SuperSeries 由 SubSeries 组成,未展开各子系列的具体内容,使用时应留意数据层级关系。此外,数据集发布时间为 Dec 09 201,年份信息不完整,引用时需核对原始记录。关于批次效应、缺失值和处理标准等质量细节,源站未提供。

【引用与许可】

引用该数据集时应注明其 GEO 编号 GSE141661 及源站标题,并参考作者 Nathanaël Lemonnier 的原始发布记录。关于该数据集的具体许可条款和使用限制,源站未提供,使用前应查阅 NCBI GEO 的相关政策及原始研究发表信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE141661

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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