BAMSE和INMA队列中哮喘、皮炎和鼻炎多病共患的全血基因表达特征
该数据集来自NCBI GEO,标题为BAMSE和INMA队列中哮喘、皮炎和鼻炎多病共患的全血基因表达特征。数据可用于研究哮喘、皮炎和鼻炎多病共患相关的全血基因表达特征(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
BAMSE和INMA队列中哮喘、皮炎和鼻炎多病共患的全血基因表达特征
GSE141661 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达数据集,标题为“A novel whole blood gene expression signature for asthma, dermatitis and rhinitis multimorbidity in BAMSE and INMA cohort”,即 BAMSE 和 INMA 队列中哮喘、皮炎和鼻炎多病共患的全血基因表达特征研究。该数据集属于呼吸系统疾病 / 哮喘分类,采用芯片表达谱技术,主题标签涉及 Expression profiling by array、GPL17586 平台和 9606(人类)。数据集由作者 Nathanaël Lemonnier 发布,发布时间为 Dec 09 201,包含 1 个文件,样例文件为 GSE141661_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集面向哮喘、皮炎和鼻炎多病共患的全血基因表达特征研究,可为相关领域的表达谱分析提供数据基础。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI GEO,源站标题为“A novel whole blood gene expression signature for asthma, dermatitis and rhinitis multimorbidity in BAMSE and INMA cohort”。从标题可以看出,该研究关注 BAMSE 和 INMA 两个队列中哮喘、皮炎和鼻炎多病共患(multimorbidity)情况下的全血基因表达特征。数据集所属分类为呼吸系统疾病 / 哮喘,主题标签包括 Expression profiling by array、GPL17586 和 9606,表明其采用芯片表达谱技术,面向人类样本。源站描述指出,该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,说明该数据集在 GEO 中属于一个整合多个子系列的超系列记录。
【数据内容】
该数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE141661_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包格式,属于 GEO 系列矩阵文件,通常用于承载样本层面的表达谱矩阵信息。数据集主题标签中的 GPL17586 指向所使用的芯片平台,9606 指向人类物种。数据内容围绕全血基因表达特征展开,可用于研究哮喘、皮炎和鼻炎多病共患相关的表达模式。除上述文件信息外,源站未提供更详细的样本数量、分组构成或基因数量等具体内容。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI GEO 公共数据库。数据集作者为 Nathanaël Lemonnier,发布时间为 Dec 09 201。源站描述说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,但具体子系列信息未在已有信息中展开。样本来源涉及 BAMSE 和 INMA 队列,研究材料为全血,检测方式为芯片表达谱(Expression profiling by array)。关于队列招募细节、样本采集流程和伦理审批等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于研究哮喘、皮炎和鼻炎多病共患相关的全血基因表达特征,适合开展表达谱层面的探索性分析,例如比较不同疾病共患状态下的基因表达模式、识别候选表达特征等。由于主题标签涉及 Expression profiling by array 和人类物种,也可用于芯片表达谱数据的整合分析或方法学验证。具体适用场景应结合数据实际样本构成和分析设计确定,源站未提供更细化的应用说明。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE141661_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因文件结构或编码问题导致分析偏差。读取后可根据系列矩阵文件中的样本信息和表达值开展后续分析。关于具体的预处理步骤、归一化方法和分析流程,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 GEO 公共数据,包含 1 个系列矩阵文件,文件数量较少,具体样本量、分组平衡性和数据完整性等信息源站未提供。由于源站描述仅说明该 SuperSeries 由 SubSeries 组成,未展开各子系列的具体内容,使用时应留意数据层级关系。此外,数据集发布时间为 Dec 09 201,年份信息不完整,引用时需核对原始记录。关于批次效应、缺失值和处理标准等质量细节,源站未提供。
【引用与许可】
引用该数据集时应注明其 GEO 编号 GSE141661 及源站标题,并参考作者 Nathanaël Lemonnier 的原始发布记录。关于该数据集的具体许可条款和使用限制,源站未提供,使用前应查阅 NCBI GEO 的相关政策及原始研究发表信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE141661
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.
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