U-BIOPRED哮喘或喘息儿童血液转录组数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE123750

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

哮喘是一种气道炎症性疾病，以发作性气道阻塞为特征，导致咳嗽和发作性气短。该病在临床和生理上具有异质性。据估计，全球约有3亿人被诊断患有哮喘，其中包括高达20%的儿童（Asher等，2006），而这些儿童中有5%–10%被认为患有重度或难以治疗的哮喘。哮喘通常根据严重程度和临床诊断标准进行分类，但现已明确，生理层面存在的异质性同样是潜在病理机制的一个特征（Lotvall等，2011）。本研究旨在确定被诊断为哮喘或喘息的儿童的血浆转录组学特征，并确定这些特征是否提示可作为这些儿童疾病基础的內型或机制，或与疾病严重程度相关。

重要的是，鉴于目前儿童与成人使用相同的药物进行治疗，我们还旨在比较儿童与成人哮喘患者的特征，以帮助确定是否应将努力方向集中于开发针对儿童特有通路和机制的药物。为此，我们使用了U-BIOPRED联盟从成人和儿童血液样本中生成的基因转录组数据，以探究在现行定义下，成人组与患有重度或轻中度哮喘的学龄前或学龄期儿童（学龄前儿童为喘息）组之间的差异基因表达谱的相似或差异程度。呼吸系统疾病结局预测的无偏生物标志物（U-BIOPRED）项目是在创新药物倡议（IMI）框架内建立的公私合作项目，汇集了学术界、制药行业和患者团体。本研究的目的是识别转录

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。