嗜酸性与中性粒细胞性哮喘患者lncRNA表达分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE117038

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

长链非编码RNA（lncRNA）已知在多种疾病中具有重要作用。已有一些报道表明，lncRNA参与哮喘全身性炎症的发病机制。lncRNA调控基因转录、蛋白表达及表观遗传调控。然而，与不同气道表型（如嗜酸性粒细胞型和中性粒细胞型哮喘）相关的lncRNA仍不清楚。我们旨在鉴定嗜酸性粒细胞型（Eos）和中性粒细胞型（Neu）样本中循环lncRNA特征的差异。研究比较了Eos患者、Neu患者和健康个体（对照）血液样本之间的lncRNA表达。采用生物信息学分析描述相关生物学通路。使用定量实时PCR测定lncRNA表达。与对照样本相比，Eos样本有190个特异性lncRNA，Neu样本有166个特异性lncRNA（差异≥2倍）。KEGG通路注释数据和GO术语显示，若干lncRNA可能与各自表型相关。通过qRT-PCR鉴定出lncRNA在Eos和Neu样本间存在显著差异。结果表明，lncRNA可能参与哮喘的不同表型。

我们能否通过这些lncRNA（作为生物标志物）识别哮喘的不同表型，尚需进一步研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。