GSE108417：不同嗜酸性、中性粒细胞及混合炎症表型哮喘的气道上皮屏障、黏蛋白与炎症小体

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE108417

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数据说明

哮喘是一种复杂的慢性呼吸系统疾病，具有显著的临床和病理生理异质性。在患者中可识别出嗜酸性粒细胞型、混合型、中性粒细胞型和寡粒细胞型哮喘等不同的炎症表型，但大多数用于研究哮喘机制的体内小鼠模型仅模拟人类的嗜酸性粒细胞型表型。目前缺乏针对哮喘模型中不同类型炎症之间分子反应的无偏倚详细体内研究。因此，我们通过不同的屋尘螨致敏方法，建立了代表三种不同气道炎症表型的小鼠模型，即嗜酸性粒细胞型、混合型和中性粒细胞型哮喘。我们使用微阵列技术测定了嗜酸性粒细胞型、混合型和中性粒细胞型炎症表型小鼠肺部的全局基因表达，以揭示临床表现背后的差异，并寻找可能反映该疾病不同分子机制的新分子靶点和通路。

通过全基因组转录组分析，我们发现气道紧密连接（TJ）分子、黏蛋白和炎症小体相关基因在不同表型的过敏性气道炎症中差异表达。随后，通过定量RT-PCR、蛋白质印迹和共聚焦显微镜对上述家族中若干分子进行详细分析，结果显示：（i）Zo-1和Cldn18在所有表型中均下调，而Cldn4上调是中性粒细胞性气道炎症的特征；（ii）黏蛋白Clca1（Gob5）和Muc5ac在嗜酸性哮喘中上调，在中性粒细胞性哮喘中上调更为明显；（iii）炎症小体相关分子如Nlrp3、Nlrc4、Casp-1和IL-1b的上调是中性粒细胞性哮喘的特征。最后，我们证明炎症小体/Th-17/中性粒细胞轴细胞因子，即IL-1b和IL-17，可损害正常和哮喘供者原代人支气管上皮细胞的上皮屏障功能并增加黏蛋白表达。O

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。