哮喘患者体内鼻病毒激发后支气管上皮细胞干扰素反应基因增强数据集
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE106388,聚焦哮喘患者体内鼻病毒 RV16 激发后支气管上皮细胞的基因表达变化

基本信息
资源简介
哮喘患者体内鼻病毒激发后支气管上皮细胞干扰素反应基因增强数据集
Enhanced interferon response genes in bronchial epithelial cells after in vivo rhinovirus challenge of asthma patients
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE106388,聚焦哮喘患者体内鼻病毒 RV16 激发后支气管上皮细胞的基因表达变化。源站描述指出,哮喘患者感染 RV16 后体内先天性和适应性干扰素反应增强而非受损,且与炎症及哮喘控制丧失强相关。数据集包含 1 个文件 GSE106388_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及高通量测序表达谱、GPL18573 平台和 9606 物种。可用于研究哮喘患者鼻病毒激发后干扰素反应相关基因表达特征,并探索其与炎症和哮喘控制之间的关联(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Oct 31 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):在哮喘中,RV16 感染后体内先天性和适应性干扰素反应表现为增强而非受损,且与炎症和哮喘控制丧失强相关。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL18573、9606。本站分类:呼吸系统疾病/哮喘。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE106388
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 07 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE106388
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
在哮喘中,RV16感染后体内先天性和适应性干扰素反应表现为过度增强而非受损,且这些反应与炎症及哮喘控制丧失密切相关。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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