全血与鼻上皮中哮喘缓解的表观基因组关联研究
该数据集来自 omicsdi.org，聚焦哮喘缓解的表观基因组关联研究。研究在纵向队列中分析全血样本（n=72）与鼻刷样本（n=97）的差异 DNA 甲基化，比较临床缓解（ClinR）和完全缓解（ComR）与持续性哮喘（PersA）
基本信息
资源简介
全血与鼻上皮中哮喘缓解的表观基因组关联研究
该数据集为一项聚焦哮喘缓解的表观基因组关联研究，英文名称为“Epigenome-wide association study of asthma remission in whole blood and nasal epithelium”，归属于呼吸系统疾病中的哮喘方向，来源站为 omicsdi.org。研究围绕哮喘患者的不同缓解状态，在纵向队列中开展差异 DNA 甲基化分析，比较临床缓解（ClinR）和完全缓解（ComR）与持续性哮喘（PersA）之间的表观遗传差异。样本覆盖全血与鼻刷两类组织，其中全血样本量为 72，鼻刷样本量为 97。数据集主题标签为 Genomics，整体定位于从表观基因组层面探索哮喘缓解相关特征，为理解哮喘缓解的分子基础提供数据资源。
【数据集背景】
哮喘是一种异质性较强的呼吸系统疾病，不同患者的病程和转归差异明显。部分患者可实现症状与用药的长期控制甚至完全缓解，而另一些患者则表现为持续性哮喘。识别与缓解状态相关的分子特征，有助于深入理解哮喘缓解的生物学机制。该数据集正是在这一背景下，针对临床缓解和完全缓解两种缓解定义，与持续性哮喘进行对比，开展表观基因组关联研究。研究采用纵向队列设计，纳入经过充分表征的哮喘患者，关注 DNA 甲基化这一表观遗传修饰形式，试图从全血和鼻上皮两种组织层面捕捉与哮喘缓解相关的差异甲基化信号。
【数据内容】
数据集的核心内容是差异 DNA 甲基化分析结果，研究对象为临床缓解（ClinR）和完全缓解（ComR），对照为持续性哮喘（PersA）。临床缓解定义为至少 12 个月内无哮喘症状且未使用药物；完全缓解则定义为在临床缓解基础上，肺功能正常且无气道高反应性。分析分别在两类样本中进行：全血样本 n=72，鼻刷样本 n=97。数据集主题标签为 Genomics，表明其属于基因组学范畴，具体聚焦于表观基因组层面的 DNA 甲基化差异。源站未提供更细化的数据文件类型、甲基化位点数量、注释信息或统计结果字段等具体内容。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。研究样本来自一个纵向队列，队列成员为经过充分表征的哮喘患者。采集的组织类型包括全血样本和鼻刷样本，分别对应全身性样本与气道局部样本。全血样本用于分析外周血中的 DNA 甲基化差异，鼻刷样本则用于分析鼻上皮中的 DNA 甲基化差异。源站未提供具体的采集时间、采集地点、队列招募方式、样本处理流程及伦理审批信息。
【适用场景】
该数据集适用于哮喘缓解相关的表观基因组研究，可用于探索临床缓解和完全缓解与持续性哮喘之间的 DNA 甲基化差异。其全血与鼻刷两类样本设计，适合比较全身性组织与气道局部组织在哮喘缓解中的表观遗传特征。潜在应用包括：筛选与哮喘缓解相关的候选甲基化标志物、开展哮喘缓解机制的假设生成研究、以及为后续验证性实验提供差异甲基化区域或位点的参考。由于涉及纵向队列中充分表征的哮喘患者，该数据集也可用于缓解定义与分子特征之间关系的探索性分析。源站未提供具体的适用分析工具或推荐流程。
【使用方法】
源站未提供具体的数据下载方式、文件格式、预处理步骤、质量控制流程、归一化方法、统计模型或分析软件等信息。使用者如需使用该数据集，应参考来源站 omicsdi.org 提供的原始说明与访问入口。源站未提供关于数据访问权限、是否需要申请或注册的具体说明。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估信息，包括样本质量、甲基化检测平台、数据完整性、批次效应处理及验证情况等。已知的样本量为全血 n=72、鼻刷 n=97，属于中等规模样本，但源站未提供统计功效或重复性验证信息。研究采用临床缓解和完全缓解两种定义，并与持续性哮喘对比，但源站未提供混杂因素控制、纵向随访时长及人群代表性等限制说明。使用者应结合原始来源信息自行评估数据适用性。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式、许可协议、使用条款或版权信息。使用者应访问 omicsdi.org 获取相关引用与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00010002026
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
临床缓解（ClinR）定义为至少12个月内无哮喘症状且未使用药物，完全缓解（ComR）定义为临床缓解且肺功能正常、无气道高反应性。我们在一个特征明确的哮喘患者纵向队列中，分析了全血样本（n=72）和鼻刷样本（n=97）中临床缓解和完全缓解与持续性哮喘（PersA）相比的差异DNA甲基化。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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