哮喘与健康志愿者支气管镜样本数据集

该数据集来源于 omicsdi.org,收录了健康志愿者与哮喘患者的支气管镜样本,属于呼吸系统疾病/哮喘方向。入组要求年龄 40–65 岁、吸烟史少于 10 包年;哮喘组需 12 岁前起病、有哮喘病史、因呼吸道症状使用吸入性糖皮质激素(可联用或不联用 β2 受体激动剂)且激发试验阳性;非哮喘对照组需

omicsdi
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基因组分类Genomics
EGAS00001001755-sc-2019-06-04T13:14:23Z - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

哮喘与健康志愿者支气管镜样本数据集

该数据集来源于 omicsdi.org,收录了健康志愿者与哮喘患者的支气管镜样本,属于呼吸系统疾病/哮喘方向。入组要求年龄 40–65 岁、吸烟史少于 10 包年;哮喘组需 12 岁前起病、有哮喘病史、因呼吸道症状使用吸入性糖皮质激素(可联用或不联用 β2 受体激动剂)且激发试验阳性;非哮喘对照组需无哮喘史、未使用哮喘相关药物、激发试验阴性、无肺功能阻塞且肺功能无损害。数据可用于哮喘相关基因组学研究(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):支气管镜样本采集自健康志愿者和哮喘志愿者。所有受试者的队列纳入标准为:年龄在 40 – 65 岁之间,吸烟史 < 10 包年。对于哮喘患者,纳入标准为:哮喘症状发病年龄 ≤12 岁,有记录的哮喘病史,因呼吸道症状使用吸入性糖皮质激素(联用或不联用 β2 受体激动剂),以及激发试验阳性(即采用 2 分钟方案,PC20 乙酰甲胆碱 ≤8mg/ml)。对于非哮喘对照,以下标准是纳入的必要条件:无哮喘病史,未使用哮喘相关药物,激发试验阴性(即采用 2 分钟方案,PC20 乙酰甲胆碱 >8 mg/ml 且 5'-单磷酸腺苷 >320 mg/ml),无肺阻塞(即 FEV1/FVC ≥70%),以及无肺功能损害(即 FEV1 ≥80% 预计值)。哮喘患者停用吸入性糖皮质激素

【主题与分类】

主题标签:Genomics。本站分类:呼吸系统疾病/哮喘。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001005064

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源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001005064

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

支气管镜检查样本采集自健康和哮喘志愿者。所有受试者的队列纳入标准为:年龄在40至65岁之间,吸烟史少于10包年。对于哮喘患者,纳入标准为:哮喘症状发病年龄≤12岁,有记录的哮喘病史,因呼吸系统症状使用吸入性皮质类固醇(伴或不伴β2-激动剂),以及激发试验阳性(即采用2分钟方案,甲胆碱PC20≤8mg/ml)。对于非哮喘对照组,以下标准为纳入所必需:无哮喘病史,未使用哮喘相关药物,激发试验阴性(即采用2分钟方案,甲胆碱PC20>8mg/ml且腺苷5’-单磷酸>320mg/ml),无肺阻塞(即FEV1/FVC≥70%),以及无肺功能损害(即FEV1≥80%预计值)。哮喘患者在全部测试前6周停止使用吸入性皮质类固醇。所有受试者均通过肺功能和激发试验进行了临床特征描述,采集了血液样本,最后受试者在镇静状态下接受了支气管镜检查。

如果受试者出现上呼吸道症状,支气管镜检查推迟≥6周。在清醒镇静状态下,采用标准化方案进行纤维支气管镜检查。本研究采集了6份肉眼观察合格的支气管内活检组织,位于右肺下叶和中叶第3至第6级支气管之间。提取的活检组织随后立即处理,延迟时间最多不超过1小时。格罗宁根大学医学中心格罗宁根医学伦理委员会批准了本研究,所有受试者均签署了书面知情同意书。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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