Bleo、哮喘、TH2与感染模型比较

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-4231

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

多种肺疾病模型中的疾病特异性基因表达谱分析 我们对12种感染、过敏和肺损伤小鼠模型中的肺基因表达进行了分析。共有24个转录本，其中许多参与炎症和免疫激活，在绝大多数模型（9个或更多）中呈现差异表达。表达模式将模型分为三组：(1) 细菌感染（n = 5），有89个转录本发生变化，其中许多与核因子-κB信号传导、细胞因子、趋化因子及其受体相关；(2) 博来霉素诱导的疾病（n = 2），有53个转录本发生变化，其中许多与基质重塑和Wnt信号传导相关；(3) 2型辅助性T细胞（过敏性）炎症（n = 5），有26个转录本发生变化，其中许多编码上皮分泌分子、离子通道和转运体。采用参考池的双色设计

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。