CENAT-H.sapiens-Asthma-ded1 儿童哮喘转录组数据集
源站描述表明,其内容是对儿童哮喘患者中选定基因进行转录谱分析。数据覆盖儿童哮喘相关基因的转录表达信息,可用于研究哮喘在儿童群体中的基因表达特征,支持差异表达分析、疾病相关基因筛选及分类建模等任务(来源 omicsdi.org)

基本信息
资源简介
CENAT-H.sapiens-Asthma-ded1 儿童哮喘转录组数据集
CENAT-H.sapiens-Asthma-ded1 是一个聚焦于儿童哮喘的转录组学数据集,其英文名称已直接体现物种(Homo sapiens)、疾病(Asthma)与数据标识(ded1)等核心信息。该数据集在分类上归属于呼吸系统疾病下的哮喘方向,来源站为 omicsdi.org。根据源站描述,该数据集的内容是对儿童哮喘患者中选定基因进行转录谱分析,主题标签为 Transcriptomics。整体而言,它围绕儿童哮喘相关基因的转录表达信息展开,可用于研究哮喘在儿童群体中的基因表达特征,并支持差异表达分析、疾病相关基因筛选及分类建模等任务。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
哮喘是一种常见的呼吸系统疾病,在儿童群体中具有较高的关注度。该数据集以儿童哮喘患者为研究对象,通过转录谱分析手段考察选定基因的表达情况。其英文名称中的 Asthma 与 H. sapiens 分别指向疾病与人类物种,ded1 为数据标识。数据集所属分类为呼吸系统疾病 / 哮喘,主题标签为 Transcriptomics,表明其属于转录组学范畴。源站描述明确指出其内容为“transcription profiling of selected genes in pediatric patients suffering from asthma”,即对儿童哮喘患者中选定基因进行转录谱分析。这一背景信息说明该数据集旨在从基因转录层面刻画儿童哮喘的分子特征,为后续的疾病机制探索与数据分析提供基础材料。
【数据内容】
该数据集的核心内容是儿童哮喘患者中选定基因的转录表达信息。源站描述表明其覆盖儿童哮喘相关基因的转录表达信息,可用于研究哮喘在儿童群体中的基因表达特征。由于聚焦于“选定基因”,其内容并非全转录组范围的全面覆盖,而是针对特定基因集合的转录谱分析。主题标签 Transcriptomics 进一步确认了其转录组学属性。基于这些信息,该数据集可支持差异表达分析、疾病相关基因筛选及分类建模等任务。关于具体的基因数量、样本量、表达值矩阵、平台信息等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。源站描述为其提供了基本的内容说明,即对儿童哮喘患者中选定基因进行转录谱分析。数据集的英文名称为 CENAT-H.sapiens-Asthma-ded1,本站分类为呼吸系统疾病 / 哮喘,主题标签为 Transcriptomics。关于样本采集的具体地点、时间、机构、伦理审批信息以及实验平台等,源站未提供。
【适用场景】
根据源站描述与主题标签,该数据集适用于儿童哮喘相关的转录组学研究。具体而言,可用于研究哮喘在儿童群体中的基因表达特征,支持差异表达分析、疾病相关基因筛选及分类建模等任务。在呼吸系统疾病尤其是哮喘的研究中,此类数据有助于从基因表达层面识别与疾病相关的候选基因,并可为构建分类模型提供数据基础。由于数据聚焦于儿童患者,其适用场景更偏向儿科哮喘的分子特征研究。关于其他潜在应用场景,源站未提供。
【使用方法】
该数据集的主题标签为 Transcriptomics,内容为选定基因的转录表达信息。使用者可基于这些转录表达信息开展差异表达分析、疾病相关基因筛选及分类建模等任务。关于数据的具体格式、下载方式、预处理步骤、分析流程或配套工具,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集聚焦于儿童哮喘患者中选定基因的转录谱分析,而非全转录组覆盖,因此其分析范围受限于所选基因集合。源站描述未提供样本量、数据完整性、批次效应、技术重复或验证实验等信息。关于数据质量评估指标、缺失值情况以及潜在偏倚,源站未提供。使用者应注意其内容为选定基因的转录表达信息,在推广至全转录组或更广泛人群时需谨慎。其他质量与限制信息,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源于 omicsdi.org,英文名称为 CENAT-H.sapiens-Asthma-ded1。关于引用方式、许可协议、使用条款或数据访问限制,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MEXP-3646
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
transcription profiling of selected genes in pediatric patients suffering from asthma
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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