健康与哮喘支气管上皮细胞RSV应答单细胞RNA测序样本数据
该数据集来自omicsdi.org，包含健康与哮喘个体支气管上皮细胞对RSV应答研究的计数矩阵及对应元数据。数据为scRNAseq数据，来源于原代细胞，经ALI培养分化后感染RSV
基本信息
资源简介
健康与哮喘支气管上皮细胞RSV应答单细胞RNA测序样本数据
该数据集收录了健康个体与哮喘个体支气管上皮细胞对呼吸道合胞病毒（RSV）应答研究的计数矩阵及对应元数据。数据属于单细胞RNA测序（scRNAseq）类型，来源于原代细胞，这些原代细胞经过气液界面（ALI）培养分化后接受RSV感染。数据集在分类上归属于呼吸系统疾病中的哮喘方向，主题标签为基因组学，来源站为omicsdi.org。整体而言，该数据集围绕支气管上皮细胞在健康与哮喘两种背景下对RSV感染的转录组响应展开，为相关研究提供单细胞水平的计数矩阵和配套样本信息。
【数据集背景】
该数据集所对应的研究聚焦于支气管上皮细胞对RSV的应答，并同时涵盖健康与哮喘两种生理状态。RSV是一种常见的呼吸道病毒，支气管上皮细胞作为呼吸道的第一道屏障，其对该病毒的响应机制在健康与哮喘个体之间可能存在差异。该研究通过单细胞RNA测序技术，在原代细胞经ALI培养分化并感染RSV的条件下，获取转录组层面的计数矩阵与元数据，以支撑对上述差异的深入分析。数据集的分类归属为呼吸系统疾病/哮喘，主题标签为基因组学，表明其应用方向与呼吸系统疾病尤其是哮喘的基因组学研究密切相关。
【数据内容】
该数据集包含计数矩阵及对应的元数据。计数矩阵用于记录单细胞RNA测序中基因表达水平的计数信息，元数据则提供与样本相关的描述性信息。数据来源于原代细胞，这些细胞经过ALI培养分化后感染RSV。研究覆盖健康与哮喘两类个体的支气管上皮细胞，因此计数矩阵和元数据能够反映两种状态下细胞对RSV应答的单细胞转录组特征。数据集英文名称为“a4fe9a3d-635f-4ea2-8824-13eda312f170 - samples”，来源站为omicsdi.org。除上述内容外，关于计数矩阵的具体基因数量、细胞数量、样本数量等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为omicsdi.org。数据来自一项针对支气管上皮细胞对RSV应答的研究，研究对象包括健康个体与哮喘个体。实验材料为原代细胞，这些原代细胞在ALI培养条件下进行分化，随后感染RSV。测序类型为scRNAseq，即单细胞RNA测序。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批信息、受试者招募标准等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于呼吸系统疾病尤其是哮喘相关的基因组学研究，特别是围绕支气管上皮细胞对RSV应答的单细胞转录组分析。由于数据同时涵盖健康与哮喘两类背景，可用于比较两种状态下支气管上皮细胞在RSV感染后的基因表达差异。此外，该数据集也可用于单细胞RNA测序数据分析方法的教学、测试或方法学比较，例如细胞类型鉴定、差异表达分析、通路富集分析等通用分析流程。但具体分析目标需结合研究者自身问题，源站未提供预设的分析场景或推荐用途。
【使用方法】
该数据集以计数矩阵和对应元数据的形式提供。使用者通常需要将计数矩阵与元数据结合，进行单细胞层面的表达分析。常见的使用方式包括数据预处理、质控、归一化、降维聚类、细胞类型注释以及差异表达分析等。由于数据涉及RSV感染与ALI培养分化条件，分析时可能需要考虑感染状态、培养条件以及健康与哮喘分组等元数据信息。关于数据的具体文件格式、读取方式、推荐软件或流程，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为单细胞RNA测序数据，来源于原代细胞并经ALI培养分化后感染RSV。关于数据质量指标，如测序深度、细胞存活率、双细胞率、批次效应等，源站未提供。关于数据的局限性，例如样本量、人群代表性、实验重复次数等，源站未提供。使用者在使用时应结合自身分析目的评估数据适用性，并注意源站未提供相关质量与限制说明这一情况。
【引用与许可】
该数据集的来源站为omicsdi.org。关于引用方式、许可协议、使用条款以及是否允许商业用途等信息，源站未提供。使用者在引用或使用该数据集时，应自行查阅来源站的相关说明，以获取准确的引用格式与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001011264
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含我们研究健康与哮喘状态下支气管上皮细胞对RSV应答的计数矩阵及相应元数据。此单细胞RNA测序数据来自原代细胞，这些细胞已在气液界面培养中分化并感染了RSV。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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