1506_Methylation_M.vd.Berge 支气管活检 DNA 甲基化数据集
该数据集来自 omicsdi.org，收录了哮喘患者、哮喘缓解期人群与健康受试者支气管活检样本的 DNA 甲基化数据，主题标签为 Genomics，本站归类为呼吸系统疾病下的哮喘
基本信息
资源简介
1506_Methylation_M.vd.Berge 支气管活检 DNA 甲基化数据集
1506_Methylation_M.vd.Berge 是一个聚焦于呼吸系统疾病中哮喘方向的 DNA 甲基化数据集，收录于 omicsdi.org。该数据集围绕支气管活检样本展开，涵盖哮喘患者、哮喘缓解期人群以及健康受试者三类研究对象，旨在从 DNA 甲基化层面呈现不同哮喘状态下气道组织的分子特征。其主题标签为 Genomics，在分类体系中归属于呼吸系统疾病下的哮喘。整体而言，该数据集为研究哮喘及其缓解状态的表观遗传学基础提供了以人体支气管活检为来源的甲基化数据资源，适合关注哮喘分子机制、生物标志物探索以及表观遗传学分析的研究者参考使用。
【数据集背景】
哮喘是一种以气道慢性炎症和可变性气流受限为特征的呼吸系统疾病，其发生发展涉及遗传与环境因素的复杂交互。DNA 甲基化作为一种重要的表观遗传修饰，能够在不改变 DNA 序列的前提下调控基因表达，因而被视为理解哮喘病理机制、疾病状态转变以及个体差异的重要切入点。该数据集正是在这一背景下，针对哮喘患者、哮喘缓解期人群与健康受试者的支气管活检样本，采集并整理了 DNA 甲基化数据，用以支持对哮喘相关表观遗传变化的比较研究。其主题标签为 Genomics，本站将其归类于呼吸系统疾病下的哮喘，说明该数据在疾病分类与组学类型上均具有明确的定位。
【数据内容】
该数据集的核心内容是 DNA 甲基化数据，样本来源为支气管活检。研究对象被划分为三类：哮喘患者、哮喘缓解期人群以及健康受试者。源站描述明确指出，该数据集反映的是“asthmatics, asthma in remission and healthy subjects”的支气管活检 DNA 甲基化情况。通过这三类人群的并列，数据集能够在同一组织来源下呈现哮喘活动期、缓解期与健康状态之间的甲基化差异。主题标签为 Genomics，表明其组学层面属于基因组学范畴。除上述信息外，关于具体甲基化位点数量、覆盖基因范围、样本量、平台型号等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org，英文名称为 1506_Methylation_M.vd.Berge。其源站描述为“DNA methylation in bronchial biopsies of asthmatics, asthma in remission and healthy subjects”。由此可知，数据的采集对象为人体支气管活检样本，采集场景围绕哮喘患者、哮喘缓解期人群与健康受试者的对比展开。支气管活检能够直接反映气道局部的组织学与分子状态，因此该来源对于研究哮喘的气道表观遗传特征具有针对性。关于具体的采集机构、采集时间、伦理审批信息、样本处理流程以及甲基化检测平台等，源站未提供。
【适用场景】
基于其数据内容与来源，该数据集适用于以下方向的研究：第一，比较哮喘患者、哮喘缓解期人群与健康受试者之间支气管活检样本的 DNA 甲基化差异，探索与哮喘活动状态或缓解状态相关的表观遗传标志；第二，从基因组学角度研究哮喘的气道局部甲基化模式，为理解疾病机制提供线索；第三，作为呼吸系统疾病尤其是哮喘方向表观遗传研究的参考数据资源，用于假设生成或与其他组学数据整合分析的探索。由于主题标签为 Genomics，该数据集也可用于基因组学相关的数据挖掘与方法验证。关于是否适用于临床诊断、预后预测或药物开发等具体应用，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过来源站 omicsdi.org 获取。使用者可根据英文名称 1506_Methylation_M.vd.Berge 在相应平台上检索并访问。由于本站分类为呼吸系统疾病 / 哮喘，主题标签为 Genomics，使用者在检索时也可结合疾病分类与组学标签进行定位。关于数据的具体下载格式、文件结构、预处理步骤、分析工具推荐以及是否需要注册或申请权限等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集聚焦于支气管活检样本的 DNA 甲基化，研究对象涵盖哮喘患者、哮喘缓解期人群与健康受试者三类，具有明确的疾病分组与组织来源。然而，关于样本量大小、甲基化检测覆盖率、数据完整性、批次效应控制、重复性验证以及是否存在缺失值等质量相关信息，源站未提供。此外，该数据集仅涉及 DNA 甲基化这一组学层面，主题标签为 Genomics，不包含转录组、蛋白组或其他组学信息。使用者在解释结果时需注意其研究设计所限定的范围，即支气管活检来源与三类研究人群的对比框架。关于该数据集是否经过独立验证或是否存在已知偏倚，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、原始文献、作者信息、发表期刊以及许可协议等内容，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时，应前往 omicsdi.org 查看其来源页面所附的具体说明，以确认是否存在引用要求、使用限制或授权条件。在未获得明确许可信息之前，建议仅将其用于符合来源站规定的用途。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00010001731
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
DNA methylation in bronchial biopsies of asthmatics, asthma in remission and healthy subjects
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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