天然α-1-抗胰蛋白酶1.5埃分辨率结构数据集(Cys232Ser突变体)

该数据集提供了α-1-抗胰蛋白酶(Cys232Ser突变体)在1.5埃分辨率下的三维蛋白质结构数据,包含原子坐标、配体分子等结构信息,通过X射线衍射技术测定,主要用于研究蛋白质折叠稳定性与α-1-抗胰蛋白酶缺乏症的病理机制,为结构生物学和疾病相关蛋白质功能分析提供高精度结构基础。

Protein Data Bank Japan
2024-06-19 更新
浏览 24
PROTEIN BINDING
Native alpha-1-antitrypsin at 1.5 Angstrom (Cys232Ser)

基本信息

创建/更新时间
2024-06-19

资源简介

天然α-1-抗胰蛋白酶1.5埃分辨率结构数据集(Cys232Ser突变体)

【一句话概览】

该数据条目为天然α-1-抗胰蛋白酶(Cys232Ser突变体)的1.5埃分辨率结构信息,属于蛋白酶抑制剂、serpin家族,涉及蛋白质结合(来源 RCSB PDB)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Native alpha-1-antitrypsin at 1.5 Angstrom (Cys232Ser)》。

【数据内容】

源站原始描述:Antitrypsin, protease inhibitor, serpin, native, protein binding

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):抗胰蛋白酶,蛋白酶抑制剂,丝氨酸蛋白酶抑制剂,天然型,蛋白质结合

【主题与分类】

主题标签:PROTEIN BINDING。

【获取与许可】

源站页面:https://www.rcsb.org/structure/8PI2

规范引用:Structural determinants of instability in alpha-1-antitrypsin () To Be Published

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源站:https://pdbj.org/mine/summary/8pi2

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是日本蛋白质结构数据库(PDBj)中公开的α-1-抗胰蛋白酶(Alpha-1-antitrypsin)蛋白质高分辨率三维结构数据,具体为Cys232Ser突变体的天然构象。数据通过X射线衍射技术测定,分辨率达到1.48埃,包含蛋白质原子坐标、配体分子(如1,2-乙二醇、二甲基亚砜)及结构描述信息。该数据集主要应用于结构生物学、蛋白质折叠与稳定性研究,特别是α-1-抗胰蛋白酶缺乏症相关的病理机制分析,为理解蛋白质错误折叠疾病提供结构基础。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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