PPGL蛋白质组数据
PPGL蛋白质组数据是公开可访问数据集，包含PPGL和正常肾上腺髓质蛋白质组数据等表格数据，围绕迷走副神经节瘤相关临床表现、影像、信号或组学信息，适合用于分类、模型训练、外部验证和疾病机制探索。
基本信息
资源简介
PPGL蛋白质组数据
【一句话概览】
为在嗜铬细胞瘤和副神经节瘤中寻找可作治疗或肿瘤成像靶点的新蛋白，研究对22份特征明确的人类PPGL样本及肾上腺髓质正常嗜铬组织进行详细蛋白质组分析。在标准定量蛋白质组分析基础上，采用针对膜蛋白质组的方法，即利用凝集素亲和或酰肼化学捕获糖肽，并富集膜内疏水跨膜片段。这些互补方法的并行应用即“Pitchfork策略”，可在不牺牲可溶性非膜蛋白信息的情况下，对人类膜蛋白质组进行深度定量分析（来源 ProteomeXchange）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Comprehensive proteomic characterization identifies potential molecular targets for therapy and imaging in the Cluster 1 human pheochromocytoma and paraganglioma》。
【数据内容】
源站原始描述：In order to identify new proteins with a potential to become targets for therapy or tumor imaging in pheochromocytoma and paraganglioma, we performed detailed proteomic analysis of 22 well-characterized human PPGL samples and normal chromaffin tissue from adrenal medulla. A standard quantitative proteomic analysis of tumor tissue was accompanied by specific membrane proteome-aimed methods, namely glycopeptide capture using lectin-affinity (Zielinska 2010) or hydrazide chemistry (Tian 2007) and e…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：为了识别在嗜铬细胞瘤和副神经节瘤中具有成为治疗或肿瘤成像靶点潜力的新蛋白质，我们对22个特征明确的人类PPGL样本以及来自肾上腺髓质的正常嗜铬组织进行了详细的蛋白质组学分析。在对肿瘤组织进行标准定量蛋白质组学分析的同时，还采用了针对膜蛋白质组的特定方法，即使用凝集素亲和（Zielinska 2010）或酰肼化学（Tian 2007）进行糖肽捕获，以及富集膜嵌入的疏水性跨膜片段（Vit et al 2016）。这些互补方法的并行应用最近被称为“Pitchfork策略”，能够在不牺牲可溶性非膜蛋白信息的情况下，对人类膜蛋白质组进行深度定量分析（Vit et al 2019）。
【数据结构与技术规格】
文件数 60 个。
【主题与分类】
主题标签：Homo sapiens (Human)、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://proteomecentral.proteomexchange.org/dataset/PXD039788
规范引用：10.1186/S12014-023-09428-7
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://proteomecentral.proteomexchange.org/dataset/PXD039788
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
PPGL蛋白质组数据包含PPGL和正常肾上腺髓质蛋白质组数据等表格数据，可用于迷走副神经节瘤相关分类、诊断建模、分型或外部验证。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
