CCLE肉瘤细胞系数据
CCLE肉瘤细胞系数据是公开可访问数据集,包含肉瘤细胞系表达、突变、拷贝数和药物依赖性矩阵等表格数据,围绕未分化多形性肉瘤相关临床表现、影像、信号或组学信息,适合用于分类、模型训练、外部验证和疾病机制探索。

基本信息
资源简介
CCLE肉瘤细胞系数据
【一句话概览】
DepMap 癌症依赖图谱门户在进入前会进行人机验证,以确认访问者为真人而非机器人,从而帮助保持门户对研究人员的响应速度。若需批量获取 DepMap 数据,可随时从下载区获取全部内容,请勿抓取门户。进入 DepMap 需启用 Cookie。该门户涉及癌症依赖图谱、DepMap 与癌症相关主题(来源 depmap.org)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《DepMap — Verification Cancer Dependency Map Portal》。
【数据内容】
源站原始描述:DepMap — Verification Cancer Dependency Map Portal Quick check before you enter We’re verifying you’re a person, not a bot. This helps keep the portal responsive for researchers. Need DepMap data in bulk? You’re always welcome to grab everything from the downloads section — please don’t scrape the portal. Enter DepMap → Cookies must be enabled to access this site
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):DepMap — 验证 癌症依赖图谱门户 进入前快速检查 我们正在验证您是真人,而非机器人。这有助于保持门户对研究人员的响应速度。需要批量获取DepMap数据?欢迎随时从下载区获取全部内容——请勿抓取门户。进入DepMap → 必须启用Cookie才能访问本网站。
【主题与分类】
主题标签:cancer dependency map、DepMap、cancer。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://depmap.org/portal/download/all/
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://depmap.org/portal/download/all/
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
CCLE肉瘤细胞系数据包含肉瘤细胞系表达、突变、拷贝数和药物依赖性矩阵等表格数据,可用于未分化多形性肉瘤相关分类、诊断建模、分型或外部验证。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
数据缺失?
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