单侧梅尼埃病鼓室内类固醇疗效随机对照双盲试验
数据围绕梅尼埃病(MD)患者 NF-κB 通路基因中新型及超罕见错义变异的负荷,涉及外显子组数据分析、表观遗传与转录组数据检索以及蛋白质建模,可用于研究遗传因素与 MD 免疫表型之间的关联(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)

基本信息
资源简介
单侧梅尼埃病鼓室内类固醇疗效随机对照双盲试验
Table 1_Burden of novel and ultra-rare missense variants in the NF-κB pathway genes associated to Ménière’s disease.xlsx
该数据集来自 frontiersin.figshare.com,包含 1 个 Excel 文件,标题为 Table 1_Burden of novel and ultra-rare missense variants in the NF-κB pathway genes associated to Ménière’s disease.xlsx。数据围绕梅尼埃病(MD)患者 NF-κB 通路基因中新型及超罕见错义变异的负荷,涉及外显子组数据分析、表观遗传与转录组数据检索以及蛋白质建模,可用于研究遗传因素与 MD 免疫表型之间的关联(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。
【数据集背景】
配套论文《Different Contribution of Missense and Loss‐of‐Function Variants to the Genetic Structure of Familial and Sporadic Meniere Disease》发表于 MedComm(2025),DOI:10.1002/mco2.70394。源站首次发布:2026-05-15。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):引言:梅尼埃病(MD)是一种内耳疾病,特征为耳鸣、感音神经性听力损失和眩晕,尽管约 60% 的患者还表现出免疫失调。转录组学研究已识别出 MD 中三种不同的免疫表型,根据系统性炎症、细胞因子谱以及与自身炎症/自身免疫合并症的关联进行分类。此外,遗传学研究显示 MD 患者中罕见变异聚集;然而,遗传因素与免疫反应之间的关系仍知之甚少。方法:在本研究中,我们分析了与 NF-κB 通路基因相关的外显子组数据,以识别可能促成 MD 中观察到的免疫表型的超罕见变异。此外,我们检索了 MD 的表观遗传和转录组数据,以寻找相关的分子特征。我们进行了蛋白质建模
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 97.04 KB。数据集 DOI:10.3389/fimmu.2026.1789753.s001。
【主题与分类】
源站学科分类:Genetic Immunology。主题标签:autoimmune、Meniere disease、NF-κB、rare variant analysis、RNAseq。本站分类:耳鼻咽喉疾病/梅尼埃病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Genetic Immunology。
【获取与许可】
源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_1_Burden_of_novel_and_ultra-rare_missense_variants_in_the_NF-_B_pathway_genes_associated_to_M_ni_re_s_disease_xlsx/32296461
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Cruz-Granados, Pablo; de Jesus, Victoria Rivero; Soto-Varela, Andres; Gonzalez-Aguado, Rocio; Lopez-Escamez, Jose A. (2026). Table 1_Burden of novel and ultra-rare missense variants in the NF-κB pathway genes associated to Ménière’s disease.xlsx. Frontiers. Dataset
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数据集获取(Figshare)
- 源站标题:Table 1_Burden of novel and ultra-rare missense variants in the NF-κB pathway genes associated to Ménière’s disease.xlsx
- DOI:10.3389/fimmu.2026.1789753.s001
- 发布日期:2026-05-15
- 文件数:1 个
- 文件总体积:97.04 KB
- 源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_1_Burden_of_novel_and_ultra-rare_missense_variants_in_the_NF-_B_pathway_genes_associated_to_M_ni_re_s_disease_xlsx/32296461
命令行下载
curl -L -o "Table 1_Burden of novel and ultra-rare missense variants in the NF-κB pathway genes associated to Ménière’s disease.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/64573950"
文件清单
Table 1_Burden of novel and ultra-rare missense variants in the NF-κB pathway genes associated to Ménière’s disease.xlsx(97.04 KB)
文件总体积 97.04 KB(源站 API 实测)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
引言梅尼埃病(MD)是一种内耳疾病,以耳鸣、感音神经性听力损失和眩晕为特征,尽管约60%的患者还表现出免疫失调。转录组学研究已识别出MD的三种不同免疫表型,其分类依据为全身性炎症、细胞因子谱以及与自身炎症/自身免疫共病的关联。此外,遗传学研究显示MD患者中存在罕见变异的聚集;然而,遗传因素与免疫反应之间的关系仍知之甚少。方法在本研究中,我们分析了与NF-κB通路基因相关的外显子组数据,以识别可能导致MD中所观察到的免疫表型的超罕见变异。此外,我们检索了MD的表观遗传学和转录组学数据,以寻找相关的分子特征。我们进行了蛋白质建模和受体-配体对接,以及差异转录本使用(DTU)和剪接预测。
结果我们在MD患者中发现了TLR9(chr3:52222299 G>C和chr3:52223761 C>A)、TNFRSF1B(chr1:12167150 C>T和chr1:12202100 G>A)及FAS(chr10:89003139 G>A和chr10:89008919 C>T)的超罕见杂合变异。剪接预测提示TLR9和TNFRSF1B变异可能产生隐匿性供体/受体位点。蛋白质建模预测三种蛋白质均存在去稳定效应,其中TNFRSF1B和FAS的原子相互作用发生改变。对接分析显示,TLR9-TLR9二聚体及FAS-FASGL模型的界面接触重新分布,可能降低结合效率,而TNFRSF1B-TRAF2对接相互作用部分得以维持。结论这些发现提示MD基于全身性炎症具有不同的免疫表型,并可能与共病的自身免疫/自身炎症性疾病相关,TLR9、TNFRSF1B和FAS的罕见变异可能参与了自身炎症的发生。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.3389/fimmu.2026.1789753.s001(source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_1_Burden_of_novel_and_ultra-rare_missense_variants_in_the_NF-_B_pathway_genes_associated_to_M_ni_re_s_disease_xlsx/32296461)。
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