囊性纤维化与慢性鼻窦炎患者鼻窦黏膜转录谱芯片数据集

该数据集来源于 EBI Expression Atlas 的差异表达实验,物种为 Homo sapiens,采用芯片技术对囊性纤维化和慢性鼻窦炎患者的鼻窦黏膜组织进行转录谱分析

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基因组分类Differential
E-GEOD-10406: Transcription profiling by array of human sinus mucosa from patients with cystic fibrosis and chronic rhinosinusitis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

囊性纤维化与慢性鼻窦炎患者鼻窦黏膜转录谱芯片数据集

E-GEOD-10406 是一项来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验数据集,物种为 Homo sapiens,采用芯片技术对囊性纤维化和慢性鼻窦炎患者的鼻窦黏膜组织进行转录谱分析。该数据集在站内归入耳鼻咽喉疾病与囊性纤维化分类,主题标签为 Differential,其英文全称为 Transcription profiling by array of human sinus mucosa from patients with cystic fibrosis and chronic rhinosinusitis。数据集聚焦于人类鼻窦黏膜在两种疾病状态下的基因表达差异,为研究者了解囊性纤维化与慢性鼻窦炎在转录层面的异同提供了可参考的公开实验资源。

【数据集背景】

囊性纤维化是一种累及多器官系统的遗传性疾病,慢性鼻窦炎则是耳鼻咽喉科常见的慢性炎症性疾病,两者在鼻窦黏膜的病理改变上存在一定关联。E-GEOD-10406 正是围绕这一交叉领域设计的转录谱研究,通过芯片技术比较囊性纤维化患者与慢性鼻窦炎患者鼻窦黏膜组织的基因表达情况。该数据集由 EBI Expression Atlas 收录,属于差异表达实验类型,其设计意图在于从全转录组层面识别两种疾病状态下表达发生变化的基因,从而为理解疾病相关的分子机制提供线索。

【数据内容】

该数据集的核心内容是来自人类鼻窦黏膜组织的转录谱芯片数据,实验对象为囊性纤维化患者和慢性鼻窦炎患者。数据以差异表达实验的形式组织,主题标签为 Differential,表明其分析重点在于组间表达差异而非单纯的表达谱展示。物种信息明确为 Homo sapiens,样本类型为鼻窦黏膜。除上述信息外,关于具体样本数量、分组规模、检测基因数量及差异表达基因列表等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,即欧洲生物信息研究所维护的 Expression Atlas 平台。源站将其描述为一项 Differential 类型的 Expression Atlas 实验,物种为 Homo sapiens,内容为对囊性纤维化和慢性鼻窦炎患者人类鼻窦黏膜的芯片转录谱分析。数据集英文名称中已标明其研究主题与样本来源。关于样本采集的具体临床地点、时间跨度、伦理审批信息及原始数据处理流程等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于比较囊性纤维化与慢性鼻窦炎患者鼻窦黏膜转录谱差异的研究场景,可用于差异表达基因的筛选、疾病相关分子通路的探索性分析,以及作为相关领域研究的公共数据参考。由于主题标签为 Differential,其典型用途包括组间表达比较和候选基因挖掘。关于该数据集在其他具体研究中的验证性应用,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 EBI Expression Atlas 平台获取,用户可依据平台提供的实验标识 E-GEOD-10406 进行检索与访问。使用时应注意其为芯片转录谱数据,分析时需考虑芯片平台特性及差异表达实验的设计特点。关于数据下载格式、预处理步骤、分析工具推荐及具体操作指南,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 EBI Expression Atlas,属于公开收录的实验资源,其物种与样本类型信息明确。但关于样本量、数据完整性、质控指标及批次效应等信息,源站未提供。使用者在解读差异表达结果时,应结合实验设计的具体细节加以判断,而相关细节在现有信息中尚未覆盖。

【引用与许可】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,使用或引用时应遵循源站的相关规定。关于具体的引用格式、许可条款及数据使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-GEOD-10406

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

表达图谱实验(差异表达)。物种:智人。采用芯片技术对囊性纤维化和慢性鼻窦炎患者的人鼻窦黏膜进行转录组分析。

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