双侧外耳缺失伴发外耳道闭锁的猪动物模型
该数据集是一个关于双侧外耳缺失伴发外耳道闭锁的猪动物模型,包含基因型、表型及胚胎发育相关的多模态数据(如基因序列、动物模型构建记录、表型描述等),主要用于研究先天性小耳畸形的遗传病因、HOXA1基因突变机制以及第一、第二鳃弓在胚胎发育中的作用,为外耳发育异常的基础研究和临床转化提供实验模型支持。

基本信息
资源简介
双侧外耳缺失伴发外耳道闭锁的猪动物模型
【数据集背景】
源站首次发布:2018-07-20。
【数据内容】
源站原始描述:小耳畸形的病因目前还不完全明确,环境和遗传因素是目前小耳畸形病因研究的重点。先天性小耳畸形在基因突变致病性研究方面还没有阐明小耳畸形胚胎发育的机制。小耳畸形主要涉及胚胎发育期间第一和第二鳃弓的异常,主要表型涉及外耳发育异常。外耳的耳廓是由第一和第二鳃弓的逐渐融合形成的,在发育过程中第一和第二鳃弓之间是相互作用,两弓之间的凹槽加深,形成外耳道,从胚胎的起源来分析,外耳的发育至少在一定程度上是由第一和第二鳃弓通过后脑的部分区域来介导的,后脑是鳃弓的神经嵴细胞的来源,在后脑的第四段基因突变可以导致外耳的发育缺陷。实验动物背景:以二花脸公猪和沙子岭母猪为祖代个体,构建近交群体。HOXA1基因突变筛查:由于HOXA1基因编码区的c.451G>TC突变导致。
【主题与分类】
主题标签:猪、小耳畸形、胚胎发育、基础医学、耳鼻喉。
【获取与许可】
源站页面:http://namr.org.cn/Ldesc/1_211
使用许可:有条件共享。
规范引用:CSTR:16397.09.0L01001207
【使用注意】
· 源站最后修改于 2021-07-28,引用时请注意版本时效。
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
本数据集是关于双侧外耳缺失伴发外耳道闭锁的猪动物模型,旨在研究先天性外耳发育异常(如小耳畸形)的病因和胚胎发育机制。数据集以二花脸公猪和沙子岭母猪为祖代个体构建近交群体,通过基因突变筛查发现HOXA1基因编码区的c.451G>TC突变是导致外耳发育缺陷的关键因素。数据内容涵盖动物模型的构建过程、基因型与表型关联信息,以及相关胚胎发育机制(涉及第一、第二鳃弓及后脑区域)的探索。该数据集主要应用于遗传学、发育生物学和医学研究,特别适用于外耳畸形病因分析、基因功能验证及动物模型在疾病机制研究中的应用。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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