前庭神经鞘瘤、非前庭神经鞘瘤与正常神经组织的基因表达数据(RNA测序)

该数据集是一个包含前庭神经鞘瘤、非前庭神经鞘瘤以及健康神经组织样本的基因表达数据集,数据模态为RNA测序(RNA-Seq)产生的转录组序列数据(fastq格式),主要用于神经鞘瘤的分子机制研究、差异基因表达分析和生物标志物发现,为神经肿瘤领域的精准医学研究提供关键数据支持。

DIGITAL.CSIC
2025-03-27 更新
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神经鞘瘤转录组学差异基因表达分析

基本信息

创建/更新时间
2025-03-27

资源简介

该数据集是一个公开的基因表达数据集,包含通过RNA测序(RNA-Seq)技术获取的转录组数据。数据来源于63个前庭神经鞘瘤样本、4个非前庭神经鞘瘤样本(VS11、VS33、VS34、VS74)以及7个健康神经组织样本(VS56、VS58、VS65、VS66、VS67、VS68、VS69)。样本均保存在RNAlater®中,使用Qiazol裂解试剂和Qiagen RNeasy mini kit提取总RNA,仅选用RNA完整性指数(RIN)大于7的高质量RNA进行测序。测序在Illumina NovaSeq X Plus平台上完成,采用PE150(双端150bp)测序策略,原始数据以fastq格式提供。该数据集主要用于研究前庭神经鞘瘤的分子特征、差异基因表达分析、肿瘤发生机制探索以及潜在的生物标志物发现,为神经肿瘤学和精准医学研究提供重要资源。

原始链接

https://digital.csic.es/handle/10261/384863

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是一个公开的基因表达数据集,包含通过RNA测序(RNA-Seq)技术获取的转录组数据。数据来源于63个前庭神经鞘瘤样本、4个非前庭神经鞘瘤样本(VS11、VS33、VS34、VS74)以及7个健康神经组织样本(VS56、VS58、VS65、VS66、VS67、VS68、VS69)。样本均保存在RNAlater®中,使用Qiazol裂解试剂和Qiagen RNeasy mini kit提取总RNA,仅选用RNA完整性指数(RIN)大于7的高质量RNA进行测序。测序在Illumina NovaSeq X Plus平台上完成,采用PE150(双端150bp)测序策略,原始数据以fastq格式提供。该数据集主要用于研究前庭神经鞘瘤的分子特征、差异基因表达分析、肿瘤发生机制探索以及潜在的生物标志物发现,为神经肿瘤学和精准医学研究提供重要资源。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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