基于多重邻近延伸读出的细胞热位移实验药物-靶点结合敏感测量数据
数据围绕细胞热位移实验（CETSA）与多重邻近延伸检测（PEA）联用方法，用于分析激酶抑制剂处理样本中 67 种蛋白质的药物-靶点结合情况，所需样本量小
基本信息
资源简介
基于多重邻近延伸读出的细胞热位移实验药物-靶点结合敏感测量数据
Sensitive Measurement of Drug-Target Engagement by
a Cellular Thermal Shift Assay with Multiplex Proximity Extension
Readout
该数据集来自 acs.figshare.com，配套 2021 年发表于 Analytical Chemistry 的论文，包含 1 个 Excel 文件。数据围绕细胞热位移实验（CETSA）与多重邻近延伸检测（PEA）联用方法，用于分析激酶抑制剂处理样本中 67 种蛋白质的药物-靶点结合情况，所需样本量小。该数据可用于评估 CETSA-PEA 在药物发现早期靶点结合筛选中的可行性，并与相应读出分析结果进行对照（来源 figshare，CC BY-NC 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Sensitive Measurement of Drug-Target Engagement by a Cellular Thermal Shift Assay with Multiplex Proximity Extension Readout》发表于 Analytical Chemistry（2021），DOI：10.1021/acs.analchem.1c02225。源站首次发布：2021-07-28。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：监测细胞环境中的靶点结合能力是成功药物发现的关键，在临床常规中也很有价值。细胞热位移实验（CETSA）可提供药物在细胞和组织中结合的真实信息，揭示临床相关样本中的药物-靶点结合。CETSA 与质谱（MS）检测联用可应用于早期命中识别阶段，为大量蛋白质生成靶点结合数据。然而，该分析速度慢、需要大量样本材料，且常常遗漏特定关注的蛋白质。在此，我们将 CETSA 与多重邻近延伸检测（PEA）联用，用于分析经激酶抑制剂处理的小量样本材料中一组 67 种蛋白质的靶点结合情况。结果与相应的读出分析一致
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 22.82 KB。数据集 DOI：10.1021/acs.analchem.1c02225.s002。
【主题与分类】
源站学科分类：Biophysics、Biochemistry、Genetics、Molecular Biology、Pharmacology、Biotechnology。主题标签：monitoring drug-target engagement、sample material、analysis、protein、sample aliquots、multiplex CETSA-PEA assays、MS、Multiplex Proximity Extension Readout、multiplex proximity extension assay、target engagement data。本站分类：其他/其他。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biophysics、Biochemistry、Genetics、Molecular Biology、Pharmacology、Biotechnology。
【获取与许可】
源站页面：https://acs.figshare.com/articles/dataset/Sensitive_Measurement_of_Drug-Target_Engagement_by_a_Cellular_Thermal_Shift_Assay_with_Multiplex_Proximity_Extension_Readout/15067721
使用许可：CC BY-NC 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/）。
规范引用：Al-Amin, Rasel A.; Gallant, Caroline J.; Muthelo, Phathutshedzo M.; Landegren, Ulf (2021). Sensitive Measurement of Drug-Target Engagement by a Cellular Thermal Shift Assay with Multiplex Proximity Extension Readout. ACS Publications. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-05，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Sensitive Measurement of Drug-Target Engagement by
a Cellular Thermal Shift Assay with Multiplex Proximity Extension
Readout - DOI：10.1021/acs.analchem.1c02225.s002
- 发布日期：2021-07-28
- 文件数：1 个
- 文件总体积：22.82 KB
- 源站页面：https://acs.figshare.com/articles/dataset/Sensitive_Measurement_of_Drug-Target_Engagement_by_a_Cellular_Thermal_Shift_Assay_with_Multiplex_Proximity_Extension_Readout/15067721
命令行下载
curl -L -o "ac1c02225_si_002.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/28974638"
文件清单
ac1c02225_si_002.xlsx（22.82 KB）
文件总体积 22.82 KB（源站 API 实测）。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
数据说明
在细胞环境中监测靶标结合能力是药物研发成功的关键，在临床常规工作中也很有价值。细胞热位移分析（CETSA）能够提供药物在细胞和组织中结合的真实信息，揭示临床相关样本中的药物-靶标结合情况。CETSA与质谱（MS）检测相结合，可应用于早期命中化合物鉴定阶段，为大量蛋白质生成靶标结合数据。然而，该分析方法速度慢、需要大量样本材料，且常常遗漏特定关注的蛋白质。在此，我们将CETSA与多重邻近延伸分析（PEA）相结合，用于分析经激酶抑制剂处理的小量样本材料中67种蛋白质的靶标结合情况。结果与通过MS读取的相应分析一致。我们的方法能够在有限的样本等分试样中，以高灵敏度对大量特定靶标蛋白质进行分析。
因此，高度灵敏的多重CETSA-PEA检测方法有望在药物开发过程中乃至临床环境下，用于监测小样本等分试样中的药物-靶点结合情况。
许可
CC BY-NC 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1021/acs.analchem.1c02225.s002（source: https://acs.figshare.com/articles/dataset/Sensitive_Measurement_of_Drug-Target_Engagement_by_a_Cellular_Thermal_Shift_Assay_with_Multiplex_Proximity_Extension_Readout/15067721）。
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