phs000415:Tourette 综合征多发病家系的全外显子与靶向测序

数据围绕 Tourette 综合征多发病家系,采用全外显子与靶向测序,并涉及扩展家系设计。可用于研究该疾病在家系中的遗传特征与相关变异(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

dbgap
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基因组分类Extended Pedigrees
phs000415: Whole Exome and Targeted Sequencing in Tourette Syndrome Multiplex Families

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

phs000415:Tourette 综合征多发病家系的全外显子与靶向测序

phs000415 是一个围绕 Tourette 综合征多发病家系开展的全外显子与靶向测序数据集,归属于神经系统疾病中的抽动障碍类别,来源于 ncbi.nlm.nih.gov。该数据集以扩展家系为设计核心,聚焦 Tourette 综合征在家族中聚集出现的遗传现象,通过全外显子测序与靶向测序两种策略获取遗传变异信息。其主题标签为扩展家系,短描述指出数据可用于研究该疾病在家系中的遗传特征与相关变异。整体而言,该数据集为探索 Tourette 综合征的家族性遗传基础提供了测序层面的资源,适合关注抽动障碍遗传机制的研究者参考使用。

【数据集背景】

Tourette 综合征是一种神经系统疾病,属于抽动障碍范畴。该数据集以多发病家系为研究对象,关注疾病在扩展家系中的传递与聚集模式。通过纳入具有多个受累个体的家系,研究设计旨在增强对遗传因素的检出能力。数据集英文名称明确指向全外显子与靶向测序,并强调家系的多发特征,说明其建立初衷是服务于 Tourette 综合征遗传基础的研究需求。来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站将其描述为 dbGaP study,并标注为扩展家系类型。

【数据内容】

该数据集包含全外显子测序与靶向测序两类数据。全外显子测序覆盖蛋白编码区域,有助于发现可能与疾病相关的编码区变异;靶向测序则针对特定区域或基因进行深度检测。数据围绕 Tourette 综合征多发病家系展开,涉及扩展家系设计,意味着样本来自具有多个受累成员的家系结构。主题标签为扩展家系,进一步表明家系信息是该数据集的重要组成部分。关于具体样本数量、测序深度、覆盖基因列表、变异位点数目等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究条目,源站描述为扩展家系研究。数据集英文名称为 phs000415: Whole Exome and Targeted Sequencing in Tourette Syndrome Multiplex Families。采集对象为 Tourette 综合征多发病家系,采用全外显子与靶向测序策略。关于采集地点、采集时间、入组标准、家系数量、受试者人数、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于研究 Tourette 综合征在家系中的遗传特征与相关变异。具体而言,可用于探索扩展家系中疾病共分离的遗传变异,分析全外显子与靶向测序所揭示的候选基因或区域,以及开展抽动障碍的家族性遗传机制研究。由于数据涉及多发病家系,也适合用于家系连锁分析或罕见变异负荷分析等遗传学研究思路。关于是否适用于特定统计方法、是否支持临床诊断用途,源站未提供。

【使用方法】

使用者可依据 dbGaP 的常规流程申请并获取该研究数据。由于数据涉及人类遗传信息,通常需要遵循数据访问与使用规范。关于具体下载方式、文件格式、分析流程、所需软件或参考基因组版本,源站未提供。建议在使用前查阅 ncbi.nlm.nih.gov 上该研究条目的最新说明,以了解访问条件与数据组织方式。

【质量与限制】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 研究条目,属于扩展家系设计。关于数据质量指标、测序覆盖度、变异检出准确性、样本排除标准、批次效应、人群代表性等,源站未提供。由于涉及家系样本,样本量与家系结构可能影响统计效力,但具体限制信息源站未提供。使用者应结合自身研究目的评估适用性。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究条目。关于引用方式、许可条款、数据使用协议、访问权限及商业使用限制等,源站未提供。使用者应直接查阅 ncbi.nlm.nih.gov 上该研究条目的官方说明,以获取准确的引用与许可要求。

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使用方式

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000415

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Extended Pedigrees).

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