淋巴瘤_PDX模型_变异基因与CNV基因列表数据
该数据集是一个包含基因变异和拷贝数变异信息的基因列表数据集,其数据模态为经过生物信息学处理的基因/位点列表文本数据。它整合了弥漫性大B细胞淋巴瘤、套细胞淋巴瘤、T细胞非霍奇金淋巴瘤和伯基特淋巴瘤这四种亚型的患者及对应PDX模型的变异信息,主要用于支持淋巴瘤的分子机制研究、PDX模型基因组特征分析以及潜在的生物标志物和药物靶点探索。

基本信息
资源简介
淋巴瘤_PDX模型_变异基因与CNV基因列表数据
【数据内容】
源站原始描述:数据集概述 本数据集包含淋巴瘤相关的过滤后变异位点及基因列表,涉及DLBCL、MCL、T-NHL、BL四种淋巴瘤类型,同时提供PDX模型样本与患者样本的共有点位、PDX模型衍生过程中获得/丢失的位点,以及预组装的CNV基因列表,可用于淋巴瘤基因变异与拷贝数变异研究。 文件详解 文件名称:Supplemental Table 4.xlsx 文件格式:XLSX
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):Dataset overview: This dataset contains filtered variant loci and gene lists related to lymphoma, covering four lymphoma types: DLBCL, MCL, T-NHL, and BL. It also provides shared loci between PDX model samples and patient samples, loci gained/lost during PDX model derivation, and pre-assembled CNV gene lists, which can be used for studies of lymphoma gene variants and copy number variations. File details File name: Supplemental Table 4.xlsx File format: XLSX...
【获取与许可】
源站页面:https://haidatas.com/dataset/linbaliu_pdxmoxing_bianyijiyinyucnvjiyinli_e8e4e853
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://haidatas.com/dataset/linbaliu_pdxmoxing_bianyijiyinyucnvjiyinli_e8e4e853
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本数据集是一个淋巴瘤基因变异与拷贝数变异研究数据集,专门聚焦于四种淋巴瘤亚型:弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、套细胞淋巴瘤(MCL)、T细胞非霍奇金淋巴瘤(T-NHL)和伯基特淋巴瘤(BL)。数据集主要包含两部分内容:一是经过过滤的高置信度基因变异位点及基因列表;二是预组装的拷贝数变异(CNV)基因列表。数据来源于对患者来源异种移植(PDX)模型和对应患者样本的对比分析,特别标注了PDX模型与患者样本共有的变异位点,以及在PDX模型建立过程中新获得或丢失的变异位点。该数据集主要用于支持淋巴瘤的分子分型、驱动基因鉴定、PDX模型基因组稳定性评估以及靶向治疗和耐药机制等相关研究。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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