淋巴瘤_PDX模型_变异基因与CNV基因列表数据

数据集获取

源站：https://haidatas.com/dataset/linbaliu_pdxmoxing_bianyijiyinyucnvjiyinli_e8e4e853

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集是一个淋巴瘤基因变异与拷贝数变异研究数据集，专门聚焦于四种淋巴瘤亚型：弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）、套细胞淋巴瘤（MCL）、T细胞非霍奇金淋巴瘤（T-NHL）和伯基特淋巴瘤（BL）。数据集主要包含两部分内容：一是经过过滤的高置信度基因变异位点及基因列表；二是预组装的拷贝数变异（CNV）基因列表。数据来源于对患者来源异种移植（PDX）模型和对应患者样本的对比分析，特别标注了PDX模型与患者样本共有的变异位点，以及在PDX模型建立过程中新获得或丢失的变异位点。该数据集主要用于支持淋巴瘤的分子分型、驱动基因鉴定、PDX模型基因组稳定性评估以及靶向治疗和耐药机制等相关研究。

数据加载示例（表格/文本类）

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))