周围神经损伤蛋白组
Peripheral Nerve Injury Proteomics PXD067006 面向周围神经损伤及相关临床研究，提供公开可访问的表格数据、标注或队列信息，适合用于分类、疾病表型分层、结构测量、风险预测和医学AI模型基准测试。
基本信息
资源简介
周围神经损伤蛋白组
【一句话概览】
对小鼠坐骨神经进行SNI后的蛋白质组学分析，揭示了外周神经损伤分子机制的新维度，受性别、发育阶段和时间进程影响。研究在既往未损伤坐骨神经图谱基础上，提供纵向蛋白质组视角，捕捉SNI后7至14天急性期与98天慢性期的变化。整合时间感知潜因子模型MEFISTO，揭示复杂蛋白质组动态及保守重组模式，发现性别共享反应呈序贯转变，并观察到免疫与神经元功能的性别差异。该资源推进了对人口学变量如何塑造外周神经可塑性及相关病理的理解（来源 ProteomeXchange）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Demographic variables shape longitudinal proteome signatures of peripheral nerve injury in mice》。
【数据内容】
源站原始描述：Our comprehensive proteomic analysis of mouse sciatic nerves following Spared Nerve Injury (SNI) reveals new dimensions of the molecular mechanisms underlying peripheral nerve injury, shaped by sex, developmental stage, and progression over time. Building on our previous work profiling naïve sciatic nerves (Xian et al., 2022), this study provides a uniquely longitudinal proteomic perspective on sciatic nerve injury, capturing both acute (7 to 14 days post SNI) and chronic (98 days post SNI) prot…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：我们对小鼠坐骨神经在保留神经损伤（Spared Nerve Injury, SNI）后的全面蛋白质组学分析，揭示了周围神经损伤分子机制的新维度，这些机制受性别、发育阶段和时间推移的影响。在我们此前对未受损坐骨神经进行蛋白质组学分析的工作基础上（Xian et al., 2022），本研究提供了一种独特的纵向蛋白质组学视角来审视坐骨神经损伤，捕捉了急性期（SNI后7至14天）和慢性期（SNI后98天）的蛋白质组变化。通过整合MEFISTO——一种时间感知的潜在因子模型，我们揭示了复杂的蛋白质组动态，并识别出保守的重组模式。值得注意的是，一种稳健的性别共享响应得以显现，反映了序贯性转变：从早期神经元损伤/修复和代谢调整，到晚期结构与转录重塑以及无菌性炎症。此外，在免疫和神经元功能方面观察到的性别偏向性差异，进一步深化了我们对周围神经损伤不同方面的认识。总之，我们提供了一个广泛的资源，推进了我们对人口统计学变量如何塑造纵向周围神经可塑性、相关病理乃至可能再生的理解。重要的是，我们的研究凸显了在临床前研究中采用包容性、时间分辨实验设计的机遇。
【主题与分类】
主题标签：proteomics、peripheral nerve injury、sex-dependent、age-dependent、Mus musculus、sciatic nerve、Spared Nerve Injury、timsTOF HT。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://proteomecentral.proteomexchange.org/cgi/GetDataset?ID=PXD067006
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://proteomecentral.proteomexchange.org/cgi/GetDataset?ID=PXD067006
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Peripheral Nerve Injury Proteomics PXD067006 是与周围神经损伤相关的公开数据集，包含表格数据，可用于分类、表型识别、疾病评估或算法验证。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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