帕金森病全基因组甲基化谱数据
该数据集包含帕金森病患者脑组织（尾状核、黑质、额叶皮层）的全基因组甲基化谱数据，采用Illumina 450K甲基化芯片技术获取，数据模态为基因组甲基化水平矩阵，主要用于研究帕金森病的表观遗传机制、探索DNA甲基化在疾病发生发展中的作用，以及进行遗传与表观遗传的整合分析。
基本信息
资源简介
帕金森病全基因组甲基化谱数据
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Whole genome methylomic profiling in Parkinson''s disease: Data》。项目资助方：Whole genome methylomic profiling in Parkinson''s disease: an integrated genetic-epigenetic approach。源站首次发布：2024-10-09。
【数据内容】
源站原始描述：This data was created for the research grant "Whole genome methylomic profiling in Parkinson''s disease: an integrated genetic-epigenetic approach" funded by Parkinson''s UK (G-1309). The data is of genome-wide methylation profiles that were obtained from the caudate nucleus (n=82), substantia nigra (n=88) and the frontal cortex (n=88) of 97 individuals with Parkinson''s disease obtained from the Parkinson Disease UK Brain Bank, using the Illumina Infinium HumanMethylation450 BeadChip
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 2.02 GB。Sample data.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，39.44 KB。数据集 DOI：10.17035/cardiff.27195645.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Biological sciences、Health sciences。主题标签：DNA Methylation、Parkinson''s Disease。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biological sciences、Health sciences。
【获取与许可】
源站页面：https://research-data.cardiff.ac.uk/articles/dataset/Whole_genome_methylomic_profiling_in_Parkinson_s_disease_Data/27195645
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Williams, Nigel (2024). Whole genome methylomic profiling in Parkinson''s disease: Data. Cardiff University. Dataset
下载信息
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是针对帕金森病研究的全基因组甲基化谱数据，由英国帕金森病研究基金会资助项目产生。数据来源于英国帕金森病脑库，包含97名帕金森病患者的脑组织样本，覆盖尾状核（82个样本）、黑质（88个样本）和额叶皮层（88个样本）三个脑区。采用Illumina Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片技术获取全基因组范围的甲基化水平。该数据集主要用于研究帕金森病的表观遗传机制，特别是DNA甲基化在疾病发生发展中的作用，为整合遗传-表观遗传分析提供重要资源。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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