路易体痴呆患者黑质致密部神经黑色素颗粒蛋白质组

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD035310

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

神经黑色素颗粒（NMGs）是人黑质致密部中存在的一类细胞器样结构。除神经黑色素外，NMGs还含有蛋白质、脂质和金属。由于含NMG的多巴胺能神经元在帕金森病和路易体痴呆（DLB）中优先丢失，推测NMGs可能在神经退行性过程中发挥作用。迄今为止，这一作用尚未被完全阐明，仍需进一步研究。因此，我们开展了一项蛋白质组学研究，以鉴定DLB患者（n=5）与健康对照（CTRL，n=5）NMGs蛋白质组谱的差异。我们采用了激光显微切割和基于质谱的方法，并使用靶向质谱实验进行验证。在DLB患者的NMG周围（SNSurr.）组织中，我们发现了持续氧化损伤和蛋白质降解受损的证据。作为一种潜在的疾病相关机制，我们发现DLB病例的NMGs中α-突触核蛋白和蛋白S100A9富集，而多种核糖体蛋白的丰度显著降低。

由于已知S100A9能够促进毒性α-突触核蛋白纤维的形成，这一发现提示NMGs参与发病机制，但NMGs究竟是起神经保护作用还是神经毒性作用，其确切角色仍需进一步研究。尽管如此，我们的研究提供了证据表明，蛋白质降解受损、持续的氧化损伤以及潜在神经毒性蛋白聚集物的积累是DLB神经变性的核心机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。