帕金森小鼠模型脑区snRNA数据集（含CDC42抑制条件）
该数据集来自可诱导表达人a-syn构建体的帕金森小鼠模型，取6、16、24月龄小鼠脑组织，从Bregma 0mm至-5mm切取脑区，使用10x Genomics Chromium 3’单细胞文库试剂盒构建单核RNA测序数据，并在NovaSeq 6000上测序，同时包含药物抑制Cdc42活性的条件
基本信息
资源简介
帕金森小鼠模型脑区snRNA数据集（含CDC42抑制条件）
该数据集为基于可诱导表达人a-syn构建体的帕金森小鼠模型所生成的脑区单核RNA测序数据，覆盖6月龄、16月龄与24月龄三个时间点，取材范围自Bregma 0mm至-5mm。数据构建采用10x Genomics Chromium 3’单细胞文库试剂盒，并在NovaSeq 6000平台上完成测序。除模型本身外，数据集还纳入了接受药物抑制Cdc42活性的实验条件，可用于比较不同年龄与不同干预状态下脑组织的转录组特征。该数据集归属于神经系统疾病/帕金森病方向，主题标签为转录组学，来源站为omicsdi.org，处理后文件可通过Zenodo获取。
【数据集背景】
帕金森病是一种常见的神经系统退行性疾病，其病理特征与α-突触核蛋白（a-syn）的异常聚集密切相关。为在转录组层面研究疾病进程及相关干预机制，该数据集依托可诱导表达人a-syn构建体的帕金森小鼠模型，选取6月龄、16月龄和24月龄三个年龄节点，以覆盖疾病发展不同阶段。同时，数据集还包含药物抑制Cdc42活性的条件，为探讨Cdc42相关通路在帕金森模型中的作用提供了转录组层面的数据基础。
【数据内容】
该数据集的核心内容为单核RNA测序数据，取材自小鼠脑组织，切取范围从Bregma 0mm至-5mm。实验分组涵盖6月龄、16月龄与24月龄的可诱导表达人a-syn构建体帕金森小鼠模型，并包含接受药理抑制Cdc42活性的条件。数据主题属于转录组学，可用于分析脑区中不同细胞核的基因表达特征。处理后文件存放于Zenodo，标识为10.5281/zenodo.21621060。
【采集与来源】
样本来自可诱导表达人a-syn构建体的帕金森小鼠模型，使用6月龄、16月龄和24月龄的小鼠。脑组织取材范围为Bregma 0mm至-5mm。文库构建使用Chromium 3’ Single Cell Library Kit（10x Genomics），测序在NovaSeq 6000平台上进行。数据来源站为omicsdi.org，处理后文件可通过Zenodo获取，对应标识为10.5281/zenodo.21621060。
【适用场景】
该数据集适用于帕金森病相关脑区转录组研究，尤其是围绕人a-syn构建体诱导表达模型在不同年龄阶段的单核表达谱分析。由于包含药物抑制Cdc42活性的条件，也可用于比较Cdc42抑制与否对转录组的影响。主题标签为转录组学，适合用于神经系统疾病特别是帕金森病方向的探索性分析。
【使用方法】
源站未提供具体使用方法。处理后文件可通过Zenodo获取，标识为10.5281/zenodo.21621060。其余使用说明源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供质量评估与限制说明。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-17455
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
使用6个月、16个月和24个月龄的可诱导表达人α-突触核蛋白构建体的帕金森病小鼠模型，我们通过切取前囟0mm至前囟-5mm的脑组织，制备了单核RNA数据集。使用了Chromium 3’单细胞文库构建试剂盒（10x Genomics），并在NovaSeq 6000上进行了测序。实验条件中包括对Cdc42活性进行药理学抑制的处理。处理后文件可在Zenodo上找到：10.5281/zenodo.21621060
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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