基于诱导表达人a-syn构建的帕金森小鼠模型脑区snRNA数据
该数据集来自基于诱导表达人a-syn构建的帕金森小鼠模型，采集6个月、16个月和24个月龄小鼠脑组织，取材范围自Bregma 0mm至-5mm，构建单核RNA（snRNA）数据集
基本信息
资源简介
基于诱导表达人a-syn构建的帕金森小鼠模型脑区snRNA数据
该数据集为基于诱导表达人a-syn构建的帕金森小鼠模型脑区单核RNA数据集，英文名称为snRNA data of Brain section from Parkinson Mouse Model based on inducible expression of human a-syn constructs。数据集来源于omicsdi.org，归类于神经系统疾病下的帕金森病方向，主题标签为Transcriptomics。其核心内容围绕帕金森小鼠模型脑组织的单核RNA测序展开，覆盖6个月、16个月和24个月龄小鼠，取材范围自Bregma 0mm至-5mm，旨在为研究帕金森病相关转录组变化提供单核分辨率的数据资源。
【数据集背景】
帕金森病是一种常见的神经系统疾病，其病理机制与a-syn异常聚集密切相关。该数据集依托诱导表达人a-syn构建的帕金森小鼠模型，通过单核RNA测序技术，在转录组层面刻画不同月龄小鼠脑组织的细胞核基因表达特征。数据集所属分类为神经系统疾病 / 帕金森病，主题标签为Transcriptomics，说明其应用方向集中在帕金森病相关的转录组研究。该数据集的构建有助于在单核水平上观察与a-syn诱导表达相关的脑组织转录变化，为后续机制探索和比较分析提供数据基础。
【数据内容】
该数据集为单核RNA（snRNA）数据集，来源于帕金森小鼠模型的脑组织切片。实验使用了6个月、16个月和24个月龄的小鼠，取材范围自Bregma 0mm至-5mm。数据构建采用Chromium 3’ Single Cell Library Kit（10x Genomics），并在NovaSeq 6000平台上完成测序。数据集的主题标签为Transcriptomics，表明其内容属于转录组学范畴。整体数据类型为单核RNA测序数据，可用于分析脑组织中细胞核的转录表达信息。关于数据的具体样本数量、测序深度、细胞核数量、基因数目等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于omicsdi.org。根据源站描述，研究使用诱导表达人a-syn构建的帕金森小鼠模型，选取6个月、16个月和24个月龄的小鼠，取脑组织切片范围自Bregma 0mm至-5mm。实验流程包括使用Chromium 3’ Single Cell Library Kit（10x Genomics）构建文库，并在NovaSeq 6000平台上进行测序。数据集的英文名称为snRNA data of Brain section from Parkinson Mouse Model based on inducible expression of human a-syn constructs。关于样本采集的具体地点、伦理审批信息、动物饲养条件等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于帕金森病相关的转录组研究，尤其是需要在单核水平上分析脑组织基因表达变化的研究场景。由于数据来自诱导表达人a-syn的帕金森小鼠模型，并覆盖6个月、16个月和24个月龄三个时间点，可用于探索不同月龄阶段脑组织的转录组特征。取材范围自Bregma 0mm至-5mm，适合针对该脑区范围内的单核RNA表达进行分析。主题标签为Transcriptomics，表明其可应用于转录组学相关的数据分析、比较研究或方法验证。关于具体的分析工具、流程或下游应用建议，源站未提供。
【使用方法】
该数据集的使用需结合单核RNA测序数据的常规处理方式。数据由Chromium 3’ Single Cell Library Kit（10x Genomics）构建，并在NovaSeq 6000平台测序，因此可按照10x Genomics单核RNA数据的标准流程进行预处理、比对和表达定量。由于数据涉及6个月、16个月和24个月龄小鼠，以及Bregma 0mm至-5mm的取材范围，使用时可依据月龄和脑区范围进行分组分析。关于数据的具体文件格式、下载方式、预处理参数、参考基因组版本等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于诱导表达人a-syn构建的帕金森小鼠模型，使用6个月、16个月和24个月龄小鼠，取材范围自Bregma 0mm至-5mm，采用Chromium 3’ Single Cell Library Kit（10x Genomics）和NovaSeq 6000测序。关于数据质量指标，如测序质量值、细胞核捕获率、双细胞率、线粒体基因比例等，源站未提供。关于数据集的限制，如样本量、批次效应、覆盖脑区范围之外的推断能力等，源站未提供。使用时应结合源站描述和自身研究目的进行判断。
【引用与许可】
该数据集来源于omicsdi.org。关于数据集的引用方式、许可协议、使用条款、是否允许商业用途、是否需要署名等，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-14889
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
使用6个月、16个月和24个月龄的可诱导表达人α-突触核蛋白构建体的帕金森病小鼠模型，我们通过切割前囟点0mm至前囟点-5mm的脑组织，制备了单核RNA数据集。使用了Chromium 3’单细胞文库构建试剂盒（10x Genomics），并在NovaSeq 6000平台上进行了测序。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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