帕金森病影像指标复现数据集

该数据包含来自两个帕金森病与对照受试者队列的影像数据,受试者招募自Emory Movement Disorders Clinic,并在两台不同的MRI扫描仪上扫描

dataone
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医学影像分类帕金森病神经系统疾病MRI影像磁化转移成像梯度回波序列队列研究
Replication of imaging metrics in Parkinson's disease

基本信息

模态
医学影像
任务类型
分类
许可
CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

帕金森病影像指标复现数据集

该数据集聚焦于帕金森病(Parkinson's disease)的影像学研究,汇集了两个独立队列的磁共振成像(MRI)数据,每个队列均包含帕金森病患者与健康对照受试者。受试者招募自Emory Movement Disorders Clinic,并分别在两台不同的Siemens 3 Tesla MRI扫描仪上完成扫描,成像协议相近。数据集以“Replication of imaging metrics in Parkinson's disease”为英文名称,归入神经系统疾病下的帕金森病分类,来源于search.dataone.org,采用CC0 1.0 Universal公共领域贡献许可发布,可供自由使用。该数据适合用于帕金森病影像指标的重复性验证、跨扫描仪与跨队列比较,以及方法学层面的可重复性研究。

【数据集背景】

帕金森病是一种常见的神经系统退行性疾病,影像学指标在其辅助诊断与疾病机制研究中具有重要价值。然而,影像指标能否在不同队列、不同扫描设备之间稳定复现,是影响研究结论可靠性的关键问题。该数据集以“影像指标的重复验证”为核心定位,专门纳入两个独立招募的帕金森病与对照受试者队列,并在两台不同的MRI扫描仪上采集数据,为检验影像指标的可重复性提供了直接的数据基础。数据来源站为search.dataone.org,本站将其归入神经系统疾病 / 帕金森病分类。

【数据内容】

该数据集包含两个队列的影像数据。队列1(Cohort 1)包括19名对照受试者和22名帕金森病患者,采用Siemens Trio 3 Tesla扫描仪,使用带有磁化传递准备脉冲的二维梯度回波序列进行采集。队列2(Cohort 2)包括33名对照受试者和39名帕金森病患者,在Siemens Prisma 3 Tesla扫描仪上以相似的成像协议完成扫描。两个队列合计涵盖52名对照受试者与61名帕金森病患者。除上述影像数据与受试者分组信息外,源站未提供更多关于具体影像指标、衍生测量值或临床量表的数据说明。

【采集与来源】

受试者均招募自Emory Movement Disorders Clinic,分为帕金森病患者与对照受试者两类。队列1的扫描设备为Siemens Trio 3 Tesla,序列为带磁化传递准备脉冲的二维梯度回波序列;队列2的扫描设备为Siemens Prisma 3 Tesla,采用与队列1相似的成像协议。两台扫描仪型号不同,这一设计使数据天然具备跨设备比较的条件。数据通过search.dataone.org发布,本站分类为神经系统疾病 / 帕金森病。关于招募时间、扫描参数细节、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

基于其双队列、双扫描仪的设计,该数据集适用于以下方向:一是帕金森病影像指标在不同队列间的重复性验证;二是跨MRI扫描仪(Siemens Trio与Siemens Prisma)的影像指标一致性评估;三是帕金森病患者与对照受试者之间影像特征的比较研究;四是影像处理与分析流程的可重复性方法学研究。由于数据涵盖两个独立队列,也可用于考察样本规模与队列构成对指标稳定性的影响。需要说明的是,具体可计算的影像指标类型取决于原始影像内容,源站未提供相关指标清单。

【使用方法】

使用者可通过search.dataone.org获取该数据集。数据按两个队列组织,每个队列内区分对照受试者与帕金森病患者,并对应不同的扫描仪与成像协议,分析时应注意按队列和扫描仪分别处理,避免将设备差异与疾病效应混淆。由于两个队列采用相似但不完全相同的成像协议,跨队列比较前宜进行协议一致性核查与必要的预处理 harmonization。关于文件格式、目录结构、图像预处理状态及配套元数据字段,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的主要优势在于双队列设计与跨扫描仪采集,能够直接支撑影像指标的重复性研究;样本量方面,队列1为41人(19名对照、22名患者),队列2为72人(33名对照、39名患者),合计113人。其限制包括:两个队列使用不同型号的扫描仪,设备差异可能影响指标可比性;受试者仅来自单一临床中心(Emory Movement Disorders Clinic),人群代表性有限;源站未提供影像指标的具体定义、临床评分、扫描参数细节及数据质量控制信息,使用者在解释结果时需谨慎。

【引用与许可】

该数据集采用CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication许可,属于公共领域贡献,使用限制较少。使用者在引用时应注明数据集英文名称“Replication of imaging metrics in Parkinson's disease”及来源站search.dataone.org。关于具体引用格式、作者列表与版本信息,源站未提供。

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源站:https://search.dataone.org/view/sha256%3Ab29ff1e92a0b1d1da36ff5a63f23d034f7a84f5192262f99228a277aabe854ae

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据包含两个队列的影像数据,分别来自帕金森病患者和对照受试者,受试者招募自Emory运动障碍诊所,并在两台不同的MRI扫描仪上完成扫描。在队列1中,19名对照者和22名帕金森病患者的影像数据通过Siemens Trio 3 Tesla扫描仪采集,采用带有磁化传递准备脉冲的二维梯度回波序列。队列2由33名对照者和39名帕金森病患者组成,他们在Siemens Prisma 3 Tesla扫描仪上以相似的成像方案完成扫描。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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