年轻与年老小鼠及帕金森与对照脑内MACS分离小胶质细胞的Bulk-RNA
该数据集为BioProject PRJEB114133，包含来自帕金森小鼠模型脑内经MACS分离的小胶质细胞的Bulk-RNA数据，样本覆盖年轻与年老小鼠以及帕金森与对照两组
基本信息
资源简介
年轻与年老小鼠及帕金森与对照脑内MACS分离小胶质细胞的Bulk-RNA
PRJEB114133 是一个聚焦帕金森病小鼠模型的 Bulk-RNA 数据集，研究对象为脑内经 MACS 分离的小胶质细胞。该数据集同时覆盖年轻与年老小鼠，并设置帕金森模型组与对照组，用以在转录组层面比较不同年龄与疾病状态下小胶质细胞的变化。数据以 BioProject 形式组织，来源于 NCBI，本站将其归类于神经系统疾病 / 帕金森病方向，主题标签为 Other。整体而言，该数据集为研究帕金森病背景下小胶质细胞的年龄相关转录特征提供了批量 RNA 测序资源，适合关注神经炎症、胶质细胞功能以及帕金森病模型机制的科研人员参考使用。
【数据集背景】
该数据集对应 BioProject 编号 PRJEB114133，英文名称为 “Bulk-RNA of MACS isolated Microglia from a Parkinson Mouse Model brain from young and old mice and Parkinson and Control”。从名称可以看出，其研究背景围绕帕金森小鼠模型展开，关注的是脑内小胶质细胞在疾病与年龄双重因素下的转录组表现。帕金森病属于神经系统疾病，小胶质细胞作为中枢神经系统中的固有免疫细胞，在该疾病背景下常被纳入研究视野。该数据集将帕金森模型与对照、年轻与年老两个维度同时纳入，形成交叉比较的设计思路。源站标题为 “Bulk-RNA of MACS isolated Microglia from a Parkins... (ID 1487374) - BioProject - NCBI”，表明其以 BioProject 记录形式发布，编号为 1487374。
【数据内容】
该数据集的核心内容是 Bulk-RNA 测序数据，测序对象为经 MACS 分离的小胶质细胞。样本来源为帕金森小鼠模型脑组织，覆盖年轻小鼠与年老小鼠，并包含帕金森组与对照组。所谓 Bulk-RNA，即对分离得到的细胞群体进行批量 RNA 测序，获得群体水平的基因表达信息，而非单细胞分辨率。MACS 分离则说明小胶质细胞是通过磁激活细胞分选方式富集获得。数据覆盖的变量包括年龄（年轻与年老）和疾病状态（帕金森与对照），因此可用于比较不同年龄、不同疾病条件下小胶质细胞的整体转录特征。源站未提供具体的样本数量、测序平台、测序深度、基因覆盖度等细节。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，以 BioProject 形式组织。BioProject 是 NCBI 提供的一种项目级记录，用于汇集与某一项研究计划相关的多种生物数据，这些数据通常来自单一机构或联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一入口，便于查找该项目所产生的不同类型数据。该数据集的源站标题显示其 BioProject ID 为 1487374，英文名称中明确标注了研究材料与分组信息。本站将其分类为神经系统疾病 / 帕金森病，主题标签为 Other。源站未提供具体的样本采集地点、时间、伦理审批信息以及实验操作流程。
【适用场景】
该数据集适用于帕金森病相关的基础研究场景，尤其是关注小胶质细胞在疾病与衰老过程中转录组变化的研究。由于同时包含年轻与年老、帕金森与对照四个维度的样本，可用于探索年龄因素与疾病因素对小胶质细胞基因表达的影响，也可用于筛选与帕金森病相关的差异表达基因或通路。对于研究神经炎症、胶质细胞激活状态以及帕金森小鼠模型分子机制的科研人员，该数据集可作为批量转录组层面的参考资源。此外，该数据集也可用于方法学比较，例如评估 MACS 分离小胶质细胞后进行 Bulk-RNA 测序的可行性。源站未提供具体的分析流程或推荐工具。
【使用方法】
该数据集以 BioProject 记录形式发布，用户可通过 NCBI 的 BioProject 入口访问该项目，并查找其关联的数据类型与下载链接。由于源站描述指出 BioProject 提供用户单一入口以查找项目产生的多样数据类型，使用者可据此定位原始测序数据或相关元数据。在使用时，建议结合项目名称中的分组信息，明确样本对应的年龄与疾病状态，以便进行分组比较。对于 Bulk-RNA 数据，常规分析思路包括质控、比对、表达定量与差异分析等，但源站未提供具体的分析步骤或参数。源站未提供数据下载的具体格式、文件大小或访问限制说明。
【质量与限制】
该数据集为 BioProject 记录，源站描述仅说明 BioProject 的一般性质，未提供该项目的具体质量控制指标，如测序质量值、重复性、批次效应评估等。样本覆盖年轻与年老、帕金森与对照，但源站未提供样本数量、生物学重复数以及统计功效等信息。由于是 Bulk-RNA 数据，其结果反映的是小胶质细胞群体的平均表达水平，无法直接推断单细胞层面的异质性。MACS 分离虽然可以富集小胶质细胞，但源站未提供分离纯度或细胞活力等验证数据。此外，该数据集基于小鼠模型，源站未提供其与人类帕金森病直接对应的结论。以上未提及的内容均属于源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式、许可协议或使用条款。用户如需引用或使用该数据集，应直接访问 NCBI BioProject 记录（ID 1487374）查看相关说明。源站未提供具体的文献出处、作者列表或数据共享政策。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB114133
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
小胶质细胞日益被认为是帕金森病（PD）的主动驱动因素，参与神经炎症、α-突触核蛋白清除以及多巴胺能神经元丢失。由于衰老是PD最强的风险因素，且独立地使小胶质细胞向预激活的促炎状态转变，因此区分年龄相关与疾病相关的转录程序至关重要。目的与工作流程 本数据集对[PD模型]和对照小鼠在[年轻]和[年老]年龄（2×2设计）的小胶质细胞进行批量转录组分析，以解析疾病、年龄及交互效应。脑组织经酶解分离，使用CD11b MicroBeads通过MACS分离小胶质细胞，提取总RNA用于批量RNA-seq文库构建，并在Novaseq 6000上测序。每组n = 3-4。包含两种性别。除Sample1外，所有样本均包含两只小鼠。测序目标为每样本40G，PE150。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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