基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

帕金森病小鼠模型脑区转录组图谱（PRJCA051743）

PRJDB41749: Transcriptomic Profiling of Brain Regions in Parkinson's Disease Mouse Models（PRJCA051743）是一个围绕帕金森病小鼠模型脑区转录组表达谱采集而建立的生物项目，源站标题为“Mus musculus (ID 1460176) - BioProject - NCBI”，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。该数据集在本站归类于神经系统疾病 / 帕金森病方向，主题标签为“Other”。整体来看，它面向帕金森病相关脑区，在转录组层面组织表达谱数据，可用于比较不同脑区在疾病模型下的基因表达差异，并为帕金森病发病机制、脑区易感性及潜在分子标志物等方向的探索性研究提供数据基础。

【数据集背景】

帕金森病是一种以脑区选择性受累为特征的神经系统疾病，不同脑区在疾病过程中的易感性和分子响应存在差异。围绕这一背景，该数据集以小鼠帕金森病模型为对象，在转录组层面采集脑区表达谱，旨在从基因表达角度刻画疾病模型下不同脑区的分子特征。其英文名称明确指向“Transcriptomic Profiling of Brain Regions in Parkinson's Disease Mouse Models”，说明数据组织核心是脑区转录组表达谱，而非单一脑区或单一分子层面。源站标题显示其与 Mus musculus（ID 1460176）相关，表明研究对象为小鼠。该数据集在本站被归入神经系统疾病 / 帕金森病分类，主题标签为“Other”，提示其主题覆盖帕金森病相关的神经生物学问题。

【数据内容】

该数据集围绕帕金森病相关脑区展开转录组层面的表达谱采集。其内容可用于比较不同脑区在疾病模型下的基因表达差异，进而支撑帕金森病发病机制、脑区易感性及潜在分子标志物等方向的探索性研究。就数据组织而言，它属于生物项目（BioProject）类型，源站描述指出，BioProject 是与单一研究计划相关、来自单一组织或联盟的生物数据集合，并为用户提供一个集中入口，以查找该项目所产生的多种数据类型。因此，该数据集并非仅包含单一类型文件，而是以项目形式汇集与帕金森病小鼠模型脑区转录组相关的数据链接和记录。关于具体样本数量、脑区名称、测序平台、表达矩阵或差异基因列表等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Mus musculus (ID 1460176) - BioProject - NCBI”。其英文名称中包含 PRJDB41749 与 PRJCA051743 两个项目编号标识，表明该记录与特定生物项目相关联。源站描述进一步说明，BioProject 记录来自单一组织或联盟，围绕单一研究计划汇集生物数据，并提供链接以访问该项目产生的多样数据类型。就采集对象而言，标题和名称均指向小鼠（Mus musculus）帕金森病模型的脑区转录组。关于样本采集地点、时间、具体实验条件、建库方法、测序深度或数据处理流程等信息，源站未提供。

【适用场景】

基于其主题和数据类型，该数据集适用于帕金森病相关脑区转录组的探索性研究。具体而言，可用于比较不同脑区在疾病模型下的基因表达差异，分析脑区易感性的分子基础，探索潜在分子标志物，以及从转录组层面理解帕金森病的发病机制。由于该数据集以生物项目形式组织，用户可通过项目入口查找与之相关的多种数据类型，适合作为二次分析、跨脑区比较或候选分子筛选的起点。对于需要明确实验设计、样本分组或统计功效的研究，仍需结合源站提供的具体记录进行判断。关于该数据集是否适用于临床诊断、药物开发或特定验证实验，源站未提供相关说明。

【使用方法】

该数据集可通过来源站 ncbi.nlm.nih.gov 访问，其源站标题为“Mus musculus (ID 1460176) - BioProject - NCBI”。用户可依据 BioProject 记录所提供的集中入口，查找与该项目相关的多种数据类型链接。由于该记录以项目形式组织，使用时应先了解项目整体范围，再根据研究目的定位脑区转录组表达谱相关数据。关于具体下载方式、文件格式、分析工具、参考基因组版本或预处理步骤，源站未提供。对于如何比较不同脑区表达差异、如何开展机制或标志物探索，源站未提供具体操作指南。

【质量与限制】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 记录，源站描述表明 BioProject 是围绕单一研究计划、来自单一组织或联盟的生物数据集合，并提供集中入口以链接多种数据类型。这有助于用户在一个项目框架下查找相关数据。但关于该数据集的具体样本量、脑区覆盖范围、测序质量、数据完整性、批次效应、归一化方法或验证程度，源站未提供。其主题标签为“Other”，本站分类为神经系统疾病 / 帕金森病，提示其应用方向，但不代表数据已经过临床验证或具备直接转化价值。使用时应结合源站记录和原始数据说明进行评估。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Mus musculus (ID 1460176) - BioProject - NCBI”，英文名称中包含 PRJDB41749 与 PRJCA051743。关于引用格式、许可条款、使用限制或数据共享政策，源站未提供。用户在使用或再分发该数据集前，应自行查阅来源站的相关记录与政策说明。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJDB41749

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJDB41749

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目旨在探究由MPTP和预形成纤维（PFF）诱导的帕金森病（PD）小鼠模型黑质与小脑的转录组改变。MPTP导致多巴胺能神经元丢失，而PFF促进突触核蛋白聚集，二者提供了互补的病理特征。研究采用RNA测序技术，对这些条件下不同脑区的基因表达进行了分析。该数据集为理解PD区域特异性的分子机制及潜在治疗靶点提供了洞见。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别