帕金森病中肠道微生物组失调与毒性胆汁酸升高相关数据集

主题标签:帕金森病、肠道微生物组、毒性胆汁酸、神经系统疾病、微生物组失调。本站分类:神经系统疾病/帕金森病。本数据集为神经系统疾病领域公开数据集,主题涵盖帕金森病。

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其他分类帕金森病肠道微生物组毒性胆汁酸神经系统疾病微生物组失调
Gut microbiome dysregulation is associated with elevated toxic bile acids in Parkinson’s disease

基本信息

模态
其他
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

帕金森病中肠道微生物组失调与毒性胆汁酸升高相关数据集

该数据集题为“Gut microbiome dysregulation is associated with elevated toxic bile acids in Parkinson’s disease”,属于神经系统疾病领域下的帕金森病方向,是一项公开可获取的研究数据集,来源为 eb i.ac.uk 平台。数据集围绕帕金森病、肠道微生物组、毒性胆汁酸及微生物组失调等主题展开,关注肠道微生物生态变化与帕金森病相关毒性胆汁酸升高之间的关联。作为神经系统疾病领域的公开数据资源,它为探索肠—脑轴机制、微生物组与神经退行性疾病关系的研究者提供了可参考的数据基础,主题涵盖帕金森病及其相关的微生物组与代谢物研究内容。

【数据集背景】

帕金森病是常见的神经退行性疾病,其发病机制涉及遗传、环境及代谢等多方面因素。近年来,肠道微生物组与神经系统疾病之间的关联受到广泛关注,微生物组失调可能通过代谢产物影响宿主生理状态。该数据集正是围绕这一研究方向构建,主题聚焦于帕金森病背景下肠道微生物组的失调现象,以及其与毒性胆汁酸水平升高之间的关联,属于神经系统疾病领域中微生物组与代谢物交叉研究的数据资源。

【数据内容】

该数据集的主题标签涵盖帕金森病、肠道微生物组、毒性胆汁酸、神经系统疾病与微生物组失调。从主题范围看,数据内容涉及肠道微生物组组成与功能相关信息,以及毒性胆汁酸这一代谢物类别的测定结果,用于支撑微生物组失调与胆汁酸毒性升高之间关联的研究。数据集在站内归类于神经系统疾病 / 帕金森病,属于该领域公开数据集。关于具体样本数量、测序平台、代谢物种类及统计指标等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 eb i.ac.uk,源站记录显示其为 PEIPEI LI 于 2021 年发布的数据集,标题为“Gut microbiome dysregulation is associated with elevated toxic bile acids in Parkinson’s disease”,并附有项目访问地址 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD020988。该来源表明数据集通过公开数据平台发布,供研究者访问与使用。关于样本采集地点、受试者招募方式、伦理审批及具体实验流程等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于神经系统疾病特别是帕金森病相关研究,可用于探讨肠道微生物组失调与毒性胆汁酸升高之间的关联,支持微生物组—代谢物联合分析、肠—脑轴机制探索等研究方向。同时,作为公开数据集,它也可用于方法学验证、生物信息学流程测试以及与其他帕金森病相关数据资源的比较研究。关于具体适用的分析软件或标准化流程,源站未提供。

【使用方法】

使用者可通过源站提供的项目访问地址获取该数据集,并依据其主题内容开展微生物组与代谢物相关的分析工作。由于数据集属于公开资源,使用时应遵循源站的使用条款与学术规范。关于数据文件格式、预处理步骤及推荐分析工具等操作细节,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集由研究者在公开平台发布,具有明确的主题范围与来源记录,便于追溯与引用。其局限性在于,当前可获取的信息主要集中于标题、主题标签与来源记录,关于样本规模、数据完整性、质量控制指标及统计效力等方面的信息,源站未提供,使用者在解读与复用时应结合原始项目页面进一步核实。

【引用与许可】

引用该数据集时,可参考源站给出的引用信息:PEIPEI LI (2021). Gut microbiome dysregulation is associated with elevated toxic bile acids in Parkinson’s disease [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD020988。关于该数据集的具体许可条款与使用限制,源站未提供。

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源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD020988

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

PEIPEI LI (2021). Gut microbiome dysregulation is associated with elevated toxic bile acids in Parkinson’s disease [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD020988

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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