GSE42581：恒河猴黑质纹状体基因表达年龄相关变化与运动功能障碍相关

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE42581

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数据说明

随着年龄增长，人类表现出运动迟缓加剧，这可能对生活质量产生不利影响。黑质纹状体系统对正常运动功能至关重要，并被认为是与年龄相关缺陷的重要部位。然而，很少有研究探讨黑质纹状体系统年龄相关变化的分子基础，或其与年龄相关运动迟缓的可能关系。本研究测量了年轻和老年恒河猴（每组n=6）的运动表现和基底神经节转录谱，并将其纳入生物信息学分析。老年受试者表现出显著的运动迟缓，并且在黑质和壳核中，随着年龄增长，神经元通路显著下调，免疫/炎症通路显著上调。然而，壳核而非黑质中的基因表达与年龄相关运动缺陷的关联更为紧密，并且几乎完全反映了下调的突触和结构可塑性通路。

与年龄相关且与运动行为相关的典型帕金森病相关基因包括：下调基因——多巴胺D2受体（DRD2）、多巴胺转运体（DAT）、酪氨酸羟化酶（TH）、Pten诱导蛋白激酶1（PINK1）、帕金森病7（PARK7）和α-突触核蛋白（SNA）；上调基因——单胺氧化酶B（MAOB）和神经细胞黏附分子1（NCAM1）。这些结果指向一个跨多个物种和脑区共有的衰老特征，而壳核显示出与运动行为相关性更强的衰老转录谱。最后，壳核中PINK1表达降低伴随MAOB表达升高，也指向一种可能加剧神经元缺陷的氧化应激机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。