帕金森病人类腹侧黑质深度细胞图谱与胰岛素抵抗的遗传分子重叠 [ipsc-DaNs]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE348131

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

帕金森病（PD）是一种以选择性神经元丢失为特征的复杂神经退行性疾病。我们将人类黑质深部全长单核测序与新型全基因组关联研究（GWAS）相结合，识别PD的遗传和细胞驱动因素。遗传风险集中于AGTR1+多巴胺能神经元和神经元周围少突胶质细胞（pODCs），二者在PD中均减少，同时也集中于少突胶质前体细胞，其在疾病扰乱的细胞间相互作用中富集。AGTR1+神经元代表一种代谢应激状态，以肾素-血管紧张素系统（RAS）和MAPK激活、氧化应激及线粒体功能障碍为特征，而非一种独特的亚型。AGTR1+神经元和pODCs将PD风险与代谢特征联系起来；在pODCs中，这种关联反映为胰岛素抵抗伴PI3K–AKT信号下调。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。