帕金森病纹状体细胞易感性与韧性分子图谱 [snRNA_seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE298848

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

多巴胺能投射至纹状体的进行性退变是帕金森病（PD）的关键疾病机制。为明确帕金森病纹状体的细胞图谱，我们对早期及进展期PD小鼠模型以及人类PD不同阶段的细胞转录组进行了绘制。我们的分析揭示了神经元和胶质细胞群体中显著的转录组变化，其中星形胶质细胞和少突胶质细胞表现出独特的疾病相关基因表达谱。值得注意的是，进行性多巴胺耗竭揭示了神经元易感性的差异，鉴定出偏心型纹状体投射神经元（SPNs）和表达Chst9的直接通路SPNs为小鼠和人类中最具恢复力的亚型。这一帕金森病纹状体细胞状态动态变化的跨物种分子图谱，揭示了选择性易感和具有恢复力的细胞类型，可为新的治疗策略提供启发。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。