新发未用药散发性帕金森病患者外周血单个核细胞全转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE290333

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究调查了帕金森病(PD)中的基因表达差异，使用了来自西班牙两家医院招募的23名新诊断、未接受药物治疗的PD患者和16名健康对照者的血液样本。参与者符合早期PD的诊断标准(Hoehn和Yahr I-II期)，且无该病家族史。研究获得了伦理批准和知情同意。分离、冷冻外周血单核细胞(PBMCs)，并进行RNA提取处理。在使用Clariom S Array (Affymetrix)进行全转录组分析前，评估了RNA完整性。数据处理在R语言环境中使用BioConductor软件包进行。质量控制措施导致排除了一个样本，并使用稳健多阵列平均(RMA)对数据进行了归一化。低表达基因和未映射到已知基因的探针被过滤掉，最终得到38个样本和18,091个探针。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。