感染与除草剂暴露涉及c-Abl激酶在α-synuclein丝氨酸129磷酸化中的作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE287574

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

帕金森病是一种复杂的多因素神经退行性疾病，其特征是路易小体中α-突触核蛋白的聚集，其中丝氨酸129位点的磷酸化（pSer129）是一个关键的病理标志。然而，将多种触发因素与统一的疾病表型联系起来的确切机制仍知之甚少。在本研究中，我们旨在探讨感染和农药暴露对pSer129 α-突触核蛋白积累的共同影响，重点关注c-Abl在此过程中的参与。RNA测序结果的功能分析表明，幽门螺杆菌和鱼藤酮均可诱导氧化应激、神经炎症和神经退行性通路。鱼藤酮和幽门螺杆菌激活了c-Abl，这可能通过诱导的氧化应激实现，并促进α-突触核蛋白磷酸化。激酶抑制剂ponatinib、nilotinib和asciminib有效挽救了pSer129 α-突触核蛋白，并逆转了鱼藤酮或幽门螺杆菌诱导的相关基因表达变化。此外，GSK3β参与了c-Abl对pSer129的诱导。进一步地，幽门螺杆菌的空泡化细胞毒素通过c-Abl在pSer129 α-突触核蛋白的磷酸化中发挥关键作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。