国际空间站微重力对iPSC来源神经类器官影响研究

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE259421

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

低地球轨道（LEO）的微重力暴露已被证明会影响人体健康。飞行后的脑部成像以及对宇航员和小鼠模型的研究表明，微重力可能导致颅内液体转移，并可能改变大脑的白质和灰质。为了聚焦微重力对脑细胞的影响，我们利用诱导多能干细胞（iPSCs）制备三维（3D）人神经类器官作为神经系统模型。我们研究了来自四个个体的iPSC衍生类器官，包括患有神经系统疾病原发性进行性多发性硬化症（PPMS）和帕金森病（PD）的患者以及无症状对照者。我们将类器官分别向皮层和多巴胺能命运模式化，以代表分别受MS和PD影响的大脑区域。小胶质细胞由相同的细胞系生成，并整合到一部分类器官中。这些类器官在国际空间站（ISS）上一种新型静态培养系统中维持了一个月，活样本被送回地球。飞行后的样本通过转录组分析进行了评估。

在含有小胶质细胞的类器官培养物中可检测到小胶质细胞特异性基因。对在LEO和地球上培养的单个类器官进行的差异基因表达分析表明，在LEO中培养的样本中细胞增殖较低，神经细胞更为成熟。这些实验为进一步研究奠定了基础，包括研究微重力对大脑影响的长期研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。