GSE247600：单细胞转录组学与体外谱系追踪揭示帕金森病细胞模型中人类iPSC来源中脑多巴胺能神经元的差异易感性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE247600

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数据说明

干细胞技术的进步为发育和疾病建模开辟了新途径。然而，这些研究的成功依赖于使用与所研究疾病靶向细胞最为相关的细胞，例如，帕金森病的中脑多巴胺能神经元。在本研究中，我们报道了通过蓝色荧光蛋白（BFP）的表达，成功构建了一株能够纯化并追踪新生中脑多巴胺能祖细胞及其分化子代的人诱导多能干细胞（iPSC）系。这是通过CRISPR/Cas9辅助将BFP和Cre分别敲入安全港位点AAVS1和早期中脑多巴胺能谱系标记基因LMX1A实现的。iPSC来源神经培养物的免疫细胞化学分析和单细胞RNA测序证实了人胎儿中脑的发育重现以及高质量中脑细胞的获得。通过使用1-甲基-4-苯基吡啶离子（MPP+）建立帕金森病相关药物毒性模型，我们展示了BFP+细胞的优先减少，这一发现通过细胞死亡检测和MPP+处理神经培养物的单细胞转录组分析得到了独立验证。

总之，这些结果突显了疾病相关细胞类型在干细胞建模中的重要性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。