GSE223138：单细胞RNA测序揭示帕金森病患者外周免疫反应及细胞特异性生物标志物

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE223138

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数据说明

帕金森病（PD）是一种以心动过缓、静止性震颤、强直和姿势不稳为特征的神经退行性疾病。目前，关于疾病严重程度与外周免疫反应之间的联系，现有认识仍不充分。在本研究中，我们采用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，对临床病例的外周血单个核细胞（PBMCs）进行了分析，包括2例早期PD、2例晚期PD和2例匹配对照，涵盖五个主要免疫细胞亚群：T细胞（CD4+、CD8+）、单核细胞、B细胞、自然杀伤（NK）细胞和造血干细胞（HSCs）。我们解析了细胞亚群比例的特征性变化，其中T细胞和NK细胞在PD进展过程中呈下降趋势。我们进一步扩大样本量，收集了14名正常个体、21例早期和14例晚期PD患者的外周血样本。随着疾病的进展，血液样本中的T细胞和NK细胞表现出明显减少。

此外，人脑切片免疫染色显示NK细胞浸润至大脑运动皮层，这证实了外周免疫反应与中枢神经系统之间存在密切交流。重要的是，NK细胞参与了众多常见的免疫相关生物学过程。引人注目的是，进一步鉴定出特异性表达于第6簇的NK细胞特异性XCL2，且其与PD严重程度呈正相关。所有这些发现阐明了外周适应性免疫反应，尤其是由NK细胞介导的免疫反应，在PD发病机制中的关键作用，为未来研究中探索PD进展过程中的免疫相关生物标志物或治疗靶点提供了线索。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。