Ataxin-2 结构区与无序区对 mRNP 颗粒形成特异性与效率的差异贡献

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE196739

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数据说明

Ataxin-2（ATXN2）是一个与脊髓小脑共济失调II型（SCA2）、肌萎缩侧索硬化（ALS）及帕金森综合征相关的基因。其编码蛋白是ALS及相关疾病的治疗靶点。ATXN2（在昆虫中称为Atx2）在翻译调控、mRNA稳定性以及mRNP颗粒的组装中发挥作用，后者是由内在无序区（IDRs）介导的过程。既往研究表明，Atx2的LSm（Like-Sm）结构域可介导某些靶mRNA的翻译激活，并拮抗mRNP颗粒的组装。本研究通过对果蝇和人源Ataxin-2蛋白进行一系列实验，进一步推进了这些发现。RNA结合蛋白靶标编辑鉴定（TRIBE）实验结果表明，Ataxin-2中与polyA结合蛋白（PABP）相互作用的PAM2基序可能是决定Ataxin-2 mRNP颗粒mRNA组成的主要因素。共定位和共免疫沉淀分析显示，Ataxin-2与PABP之间的结构化相互作用还有助于决定Ataxin-2相关mRNP颗粒的蛋白组分，并促进Ataxin-2与应激颗粒的关联。

最后，在果蝇体内的实验表明，虽然Atx2-LSm结构域对神经退行性变具有保护作用，但结构化的PAM2相互作用和非结构化的IDR相互作用均促进神经退行性变。综上所述，这些数据：(a) 提出了Ataxin-2相互作用在翻译控制不同阶段如何被重塑的设想；(b) 展示了Ataxin-2的结构化和非结构化相互作用如何以不同方式贡献于RNP颗粒凝聚的特异性和效率；© 证明了Ataxin-2蛋白包含多种活性，这些活性可能分别阻止或促进神经退行性变。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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