帕金森病阑尾中自噬-溶酶体系统的表观遗传失活

该数据集来自 NCBI GEO,标题为帕金森病阑尾中自噬-溶酶体系统的表观遗传失活,属于神经系统疾病/帕金森病分类。源站描述表明这是一个 SuperSeries,由下方列出的 SubSeries 组成,文件数量为 1,样例文件为 GSE135751_series_matrix.txt.gz,主题标签

geo
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基因组分类GPL167919606
GSE135751: Epigenetic inactivation of the autophagy-lysosomal system in the Parkinson’s disease appendix

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

帕金森病阑尾中自噬-溶酶体系统的表观遗传失活

GSE135751 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达数据集,标题为“Epigenetic inactivation of the autophagy-lysosomal system in the Parkinson's disease appendix”,即帕金森病阑尾中自噬-溶酶体系统的表观遗传失活。该数据集归入神经系统疾病 / 帕金森病分类,由作者 Peipei Li 发布,发布时间为 Aug 12 201。源站描述表明这是一个 SuperSeries,由下方列出的 SubSeries 组成。数据集包含 1 个文件,样例文件为 GSE135751_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及高通量测序表达谱分析,并标注了 GPL16791 平台与物种编号 9606。

【数据集背景】

该数据集聚焦帕金森病相关研究,标题指向帕金森病阑尾组织中自噬-溶酶体系统的表观遗传失活这一主题。帕金森病属于神经系统疾病,阑尾组织作为研究材料在该数据集中被明确提及。数据集通过高通量测序进行表达谱分析,主题标签中包含 Expression profiling by high throughput sequencing,说明其数据属于基因表达谱类型。源站将其组织为 SuperSeries 结构,意味着该条目本身是对若干 SubSeries 的汇总,具体 SubSeries 内容源站未提供。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE135751_series_matrix.txt.gz,从文件名判断为系列矩阵文件,并以 GZIP 压缩格式提供。主题标签中列出了 GPL16791 平台和物种编号 9606,表明数据涉及人类样本的表达谱信息。除该样例文件外,源站未提供更多文件层面的细节,例如矩阵中的具体字段、样本数量、基因数量或分组信息。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,未展开各 SubSeries 的具体内容。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI GEO,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。作者为 Peipei Li,发布时间为 Aug 12 201。数据集标题与源站标题一致,均为“Epigenetic inactivation of the autophagy-lysosomal system in the Parkinson's disease appendix”。关于样本采集的具体地点、时间跨度、伦理审批信息以及测序平台的具体型号,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于帕金森病相关表达谱研究,尤其是围绕阑尾组织中自噬-溶酶体系统表观遗传失活这一主题的分析。由于主题标签包含高通量测序表达谱分析,可用于基因表达层面的数据探索与比较。数据集归入神经系统疾病 / 帕金森病分类,适合在该疾病领域内作为表达谱数据资源使用。关于具体的分析类型、对照设置或验证用途,源站未提供。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE135751_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。由于源站未提供矩阵文件的详细字段说明,读取时应以实际文件内容为准进行核对。对于 SuperSeries 与 SubSeries 之间的对应关系,源站未提供进一步说明,使用前需自行确认数据组织方式。

【质量与限制】

该数据集文件数量为 1,样例文件为系列矩阵文件,源站未提供关于数据质量评估、缺失值处理、批次效应或标准化方法的说明。源站描述仅表明这是由 SubSeries 组成的 SuperSeries,未列出 SubSeries 清单及其内容,因此数据覆盖范围与完整性无法从现有信息判断。发布时间标注为 Aug 12 201,年份信息不完整。主题标签中的平台与物种编号可供参考,但平台具体配置与样本注释信息源站未提供。

【引用与许可】

作者为 Peipei Li,数据来源于 NCBI GEO。关于该数据集的引用方式、许可条款或使用限制,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据前,应自行查阅源站页面获取相关说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE135751

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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