猕猴黑质纹状体神经元扩散张量成像测量验证数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.2f8j75d

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 22.62 GB。

数据说明

目的：在活体脑内解读弥散MRI需要与金标准组织学测量进行验证。我们在经MPTP（一种对多巴胺能神经元具有选择性的毒素）诱导单侧黑质纹状体损伤程度不同的非人灵长类动物（NHPs）中，将黑质纹状体通路的弥散值与PET及组织学结果进行了比较。方法：16只NHP在单侧颈动脉输注不同剂量MPTP前后接受了三种不同突触前放射性配体的MRI和PET扫描，以及盲法视频运动评分。计算了中脑与纹状体之间连接的弥散测量值。随后处死动物，以定量纹状体多巴胺浓度、纹状体酪氨酸羟化酶（TH）免疫染色纤维密度的立体学测量值，以及TH染色黑质细胞的无偏立体学计数。结果：弥散测量值与MPTP剂量、黑质TH阳性细胞体和纹状体TH阳性纤维密度相关，但与体外黑质纹状体终末区测量值或体内PET测量的纹状体突触前标志物摄取不相关。

一旦黑质TH细胞计数损失超过50%，立体学终末场测量值即达到接近零的地板效应，但扩散测量值仍与黑质细胞计数相关。结论：黑质纹状体束的扩散测量值与黑质多巴胺神经元及纹状体纤维密度相关，但其与终末场测量的关系与既往关于突触前神经元纹状体PET测量的报告相同。这些扩散测量值有潜力作为黑质纹状体损伤严重程度的无创指标。黑质纹状体束的扩散成像可能对帕金森病或相关疾病患者具有诊断价值。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。