淀粉样变性与神经退行性疾病靶点结构图谱——神经研究数据集 v1.0

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.19829881

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 6.3 KB。

数据说明

摘要 本数据集包含12个主要神经退行性疾病靶点的结构序列、无序注释和疾病关联信息。所收录的蛋白质涵盖主要神经退行性病理类型：α-突触核蛋白及PINK1/Parkin/LRRK2（帕金森病）、Tau蛋白及淀粉样蛋白-β 42（阿尔茨海默病）、亨廷顿蛋白（亨廷顿病）、TDP-43、FUS及SOD1（肌萎缩侧索硬化症）、朊蛋白（传染性海绵状脑病）、胰淀素/IAPP（2型糖尿病相关淀粉样变性）以及CREB1（神经可塑性）。每条记录包含UniProt登录号、可获取的DisProt无序标识符以及全长氨基酸序列。该资源可支持蛋白质聚集、纤维成核的计算研究以及聚集抑制剂的理性设计。通俗语言摘要 阿尔茨海默病、帕金森病、亨廷顿病和ALS等神经退行性疾病的特征在于特定蛋白质在大脑中异常聚集，从而损伤并杀死神经细胞。本数据集提供了参与这些疾病的12种关键蛋白质的完整分子序列。

通过公开这些数据，我们使研究人员能够精确研究这些蛋白质如何以及为何错误折叠和聚集，这是开发能够预防或逆转驱动神经退化的蛋白质聚集的药物的关键一步。相关资源 源代码：GitHub — Nexus Resonance Codex / Protein-Folding 作者简介：ORCID — James Paul Trageser 作者：@jtrag on X 联系方式：NexusResonanceCodex@gmail.com 本系列相关数据集 渗透应激反应蛋白 — 农业基因组学数据集 致癌驱动突变 — 癌症研究数据集 罕见儿科遗传病 — 儿科研究数据集

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。