α-突触核蛋白降解组基础图谱

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5522/04/29436401.v1

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该开放获取资源库提供了α-突触核蛋白降解组基础图谱。该图谱包含了一个高分辨率、注释详尽的数据集，涵盖了具有完整氨基酸序列和详细生化元数据的蛋白水解α-突触核蛋白片段。α-突触核蛋白是帕金森病(PD)、多系统萎缩(MSA)和路易体痴呆(DLB)发病机制中的关键蛋白质。

该数据集包含野生型和临床相关α-突触核蛋白变体的降解图谱，因此不仅适用于经典生物标志物发现，还可作为神经退行性疾病中AI驱动方法的训练和基准测试资源。无论您的工作涉及生物标志物开发、精准神经病学还是机器学习，该数据集都提供了结构化的标注输入，非常适合用于：训练监督模型以检测或预测切割位点；从蛋白质序列中进行特征提取；按突变或疾病背景对片段类型进行聚类或分类；与组学数据整合以用于多模态预测任务。数据集特征：注释的α-突触核蛋白蛋白水解片段；包含野生型和临床相关变体；制表符分隔的ASCII格式，兼容Python、R和ML框架；链接的SAS和Python脚本，用于流程可重复性和更新；可直接用于计算建模、AI训练和生物信息学工作流。该数据集使用涉及Python、BLAST和SAS的可重复代码生成。

所有脚本均已提供，并在随附的出版物[1]和数据集/代码仓库[2,3]中完整记录。该图谱非常适合神经科学、蛋白质组学、生物信息学和人工智能领域的研究人员，他们正在构建工具以理解、预测和干预与人类疾病相关的蛋白质降解通路。参考文献：Petzold A. Proteolysis-Based Biomarker Repertoire of the Neurofilament Proteome. J Neurochem. 2025;169(3):e70023. https://doi.org/10.1111/jnc.70023Petzold, Axel (2024). N

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。