后脑体温调节反应

其英文名称直译大意为“后脑的体温调节反应”,指向体温调节相关神经活动这一研究主题。DANDI Archive 是面向神经科学数据的公开存档平台,用于汇集、保存和分发以 NWB(Neurodata Without Borders)标准组织的神经生理学数据

dandi
2022-08-31 更新
浏览 31
其他神经电生理钙成像NWB格式斑马鱼模型体温稳态温度刺激感觉运动整合神经系统疾病
Thermoregulatory Responses Hindbrain

基本信息

模态
其他
创建/更新时间
2022-08-31
版本
0.230316.1655

资源简介

后脑体温调节反应

Thermoregulatory Responses Hindbrain 是一个神经生理学数据集,在 dandiarchive.org 上以 DANDI Archive 的 dandiset 000237 形式发布,在来源站点被归入“神经系统疾病 / 其他”类别。其英文名称直译大意为“后脑的体温调节反应”,指向体温调节相关神经活动这一研究主题。

【数据集背景】

DANDI Archive 是面向神经科学数据的公开存档平台,用于汇集、保存和分发以 NWB(Neurodata Without Borders)标准组织的神经生理学数据。NWB 是社区推动的数据格式规范,目标是让电生理、光学记录等实验数据以统一结构存储,便于跨实验室交换与再利用。该数据集被标注为 NWB 标准的神经生理学数据,并与 BRAIN Initiative 相关联。体温调节是生理学与神经科学中的经典问题,涉及机体在环境温度变化条件下对产热与散热过程的协调控制,而后脑(菱脑)区域在相关神经回路研究中受到关注。上述内容属于领域背景说明,该数据集具体涉及的物种、脑区定位、实验条件等信息,源站未提供。

【数据内容】

从来源站的描述看,该数据集属于以 NWB 标准组织的神经生理学数据,主题与体温调节反应相关。除此之外,数据所包含的具体记录模态、样本量、记录时长、受试个体数量、实验分组与刺激条件等,源站未提供。

【采集与来源】

该数据来源于 dandiarchive.org,在该平台上的条目编号为 dandiset 000237。源站给出的联系人为 Haesemeyer, Martin。至于数据在何机构、以何种实验装置采集,采集时间、伦理审批信息以及原始数据与处理后数据之间的关系等,源站未提供。

【适用场景】

作为采用 NWB 标准的神经生理学数据资源,此类数据通常可用于神经环路与生理调控方向的二次分析、方法比较与教学演示;就体温调节这一主题而言,领域内常见的用途包括对温度相关神经反应的分析。该数据集本身被推荐或预期用于哪些具体场景,源站未提供。

【使用方法】

NWB 标准的数据一般可借助支持该格式的通用读取工具进行访问,以便在常见分析流程中加载、查看与处理。关于该数据集的具体下载方式、文件目录结构、依赖环境与处理示例,源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、缺失情况、噪声水平、可复现性以及使用限制的说明。使用者在基于该数据开展分析之前,需要自行核实其格式合规性、标注完整性与适用范围。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式与许可条款信息。如需引用或确认使用条件,可查阅源站对应条目,并通过源站所列联系人 Haesemeyer, Martin 进一步了解。

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使用方式

数据集获取

源站:https://dandiarchive.org/dandiset/000237

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive 数据集 000237。符合 NWB 标准的神经生理学数据集(BRAIN Initiative)。联系人:Haesemeyer, Martin。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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