粪菌移植的安全性与有效性

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT04014413

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：克罗恩病、溃疡性结肠炎、乳糜泻、肠易激综合征、功能性发声障碍、便秘、艰难梭菌感染、糖尿病。肠道微生物群对健康至关重要，其功能复杂程度堪比器官系统。肠道微生物群生态失调，即肠道微生物群生态的改变，已被认为与多种疾病状态有关。粪菌移植（FMT）是指将健康供体的粪便输注给受影响的对象，是一种恢复肠道微生物群平衡的方法，近年来因其有效性和易用性而引起了极大的兴趣。现在，FMT被推荐为对标准疗法无应答的CDI最有效的治疗方法。最近的研究表明，生态失调与多种疾病有关，而FMT可能是一种有用的治疗方法。已经在多种疾病中进行了随机对照试验，并显示出积极的结果，包括酒精性肝炎、克罗恩病（CD）、溃疡性结肠炎（UC）、储袋炎、肠易激综合征（IBS）、肝性脑病和代谢综合征。

病例系列/报告和初步研究表明，在其他疾病中也显示出积极结果，包括乳糜泻、功能性消化不良、便秘、代谢综合征如糖尿病、多重耐药、肝性脑病、多发性硬化、假性肠梗阻、耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌（CRE）或耐万古霉素肠球菌（VRE）感染、放射性毒性、多器官功能障碍、菌群失调性肠病、MRSA肠炎、伪膜性肠炎、特发性血小板减少性紫癜（ITP）和特应性疾病。尽管FMT在治疗多种疾病方面似乎相对安全有效，但其在常规临床环境中的安全性和有效性尚不清楚。需要更多数据来证实FMT的安全性和有效性。因此，研究者旨在开展一项初步研究，以探讨FMT在多种菌群失调相关疾病中的有效性和安全性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。