Vx-445在内质网应激条件下恢复细胞稳态：生化与蛋白质组学分析_表达蛋白质组学_2

数据集获取

源站：https://doi.org/10.17632/hnrrpyyrvz.1

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数据集大小约 6.51 GB。

数据说明

内质网应激是一种病理生理状态，在多种人类疾病的发展中起着核心作用。多种细胞内和细胞外因素可损害蛋白质折叠，导致蛋白质错误折叠疾病。囊性纤维化是一个显著例子，其药物治疗依赖于调节剂的组合——如校正剂Vx-445，其靶向囊性纤维化跨膜传导调节因子(CFTR)的缺陷。迄今为止，体外结合试验无法证明校正剂与细胞环境中的CFTR之间存在直接相互作用，使其确切作用机制尚未阐明。因此，本研究旨在探讨Vx-445在神经细胞中的作用，在使用Thapsigargin(肌浆/内质网Ca2±ATP酶(SERCA)的特异性抑制剂)诱导内质网应激后，通过涉及生化测定、无标记和功能蛋白质组学的多学科方法进行研究。我们的研究结果表明，Vx-445可能参与氧化应激的调节，其能够降低细胞内ROS水平即为证据。

此外，它还能影响钙稳态，因为它能够使该系统恢复至基础状态，并且似乎参与调节细胞凋亡，这体现在其降低细胞色素c释放的能力上。这些结果得到了表达蛋白质组学和DARTS（药物亲和响应靶稳定性）分析的支持，这两项分析旨在鉴定Vx-445恢复的主要细胞通路以及潜在的蛋白质相互作用伙伴。总体而言，这些发现可能增进我们对CFTR调节剂细胞靶点的理解，并为药物重定位策略提供新机遇。该数据集包含表达蛋白质组学实验的Thapsigargin原始数据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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