3.5年每周静息态fMRI可重复性与时间结构数据集
我们获取了一名健康志愿者(首次扫描时40岁;男性)的纵向单被试数据集。在185周(略超过3年)的时间内,每周采集一次MRI数据,共采集了158次MRI数据

基本信息
资源简介
3.5年每周静息态fMRI可重复性与时间结构数据集
该数据集名为“Reproducibility and Temporal Structure in Weekly Resting-State fMRI over a Period of 3.5 Years”,来源于neurovault.org,本站归类为神经系统疾病/其他。数据集记录了一名健康志愿者(首次扫描时40岁,男性)在185周(略超过3年)内每周接受一次MRI扫描的纵向单被试数据,共完成158次MRI数据采集。扫描在3T Philips Achieva扫描仪上进行,静息态功能磁共振数据采用多层面SENSE-EPI脉冲序列获取,扫描参数包括TR/TE = 2000/30 ms、SENSE因子2、翻转角75°、37个轴位层面、标称分辨率3×3×3 mm³、层间距1 mm、16通道神经血管线圈、每次运行200个动态帧。该数据集的核心价值在于以周为尺度长期追踪同一被试的静息态脑活动,为研究静息态fMRI信号的可重复性与时间结构提供了独特资源。
【数据集背景】
该数据集旨在支持对静息态功能磁共振成像(rs-fMRI)长期可重复性与时间结构的研究。通过在同一名健康志愿者身上以每周一次的频率持续采集数据,跨越185周(略超过3年),研究者能够考察静息态脑活动测量在长时间尺度上的稳定性与变异模式。被试在首次扫描时为40岁男性,属于健康志愿者,这为观察无明确疾病背景下的自然波动提供了基础。数据集的纵向单被试设计使其特别适合分析个体内信号的时间依赖性,而非群体间的横断比较。
【数据内容】
数据集包含158次MRI采集会话,覆盖185周的时间跨度,每周采集一次。每次会话包含静息态fMRI数据,采用多层面SENSE-EPI脉冲序列采集,具体参数为:TR/TE = 2000/30 ms,SENSE因子2,翻转角75°,37个轴位层面,标称分辨率3×3×3 mm³,层间距1 mm,使用16通道神经血管线圈,每次运行采集200个动态帧(帧数)。静息态fMRI扫描总是在T1w扫描之后进行,以便被试适应扫描仪内的噪声和环境。扫描期间,被试被要求尽可能保持静止并闭眼,未提供其他指令(源站描述在此处截断)。数据来源站为neurovault.org,本站分类为神经系统疾病/其他。
【采集与来源】
数据采集使用3T Philips Achieva扫描仪(Philips HealthCare, Best, Netherlands)。静息态fMRI数据通过多层面SENSE-EPI脉冲序列获取,参数如上所述。采集策略为纵向单被试设计,每周一次,持续185周,共158次会话。每次静息态扫描安排在T1w扫描之后,以帮助被试适应扫描环境。被试在扫描中保持闭眼和静止。数据来源于neurovault.org,本站将其归入神经系统疾病/其他类别。源站未提供更多关于数据预处理、存储格式或共享方式的具体信息。
【适用场景】
该数据集适用于研究静息态fMRI信号在长期(数周至数年)尺度上的可重复性与时间结构。由于采用单被试纵向设计,它可用于分析个体内功能连接或活动模式随时间的波动、评估测量稳定性、考察时间自相关特征,以及为方法学研究提供长期重复测量的基准数据。此外,该数据可用于探索扫描参数(如TR/TE、分辨率、线圈配置)在长期采集中的一致性影响。本站分类为神经系统疾病/其他,但数据集本身来自健康志愿者,因此更适用于方法学与正常生理波动研究,而非疾病群体分析。源站未提供具体的分析案例或应用示例。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明,包括数据下载方式、文件组织格式、预处理建议或分析工具推荐。用户需参考neurovault.org上的原始条目获取进一步信息。基于一般常识,使用此类纵向静息态fMRI数据时通常需要关注会话间配准、头动校正、信号漂移以及时间序列建模等步骤,但源站未提供针对该数据集的具体操作指南。
【质量与限制】
数据集为单被试纵向设计,样本量有限,结论的普适性受限于个体特异性。采集跨越185周,共158次会话,存在会话间隔不完全均匀的可能(每周一次但总周数多于会话数)。源站描述在“no other instruction wa”处截断,未提供完整的扫描指令信息。源站未提供关于数据质量评估、头动控制指标、信噪比或缺失数据的详细说明。此外,源站未提供伦理审批、数据共享许可或使用限制的具体条款。
【引用与许可】
源站未提供引用格式或许可信息。用户在使用该数据集时应参考neurovault.org原始条目获取引用要求与许可条款。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://neurovault.org/collections/858
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们获取了一名健康志愿者(初次扫描时年龄40岁,男性)的纵向单被试数据集。在185周(略超过3年)的时间内,每周采集一次MRI数据,共获得158次扫描数据。受试者使用3T Philips Achieva扫描仪(Philips HealthCare,荷兰贝斯特)进行扫描。受试者的静息态功能磁共振(rs-fMRI)数据采用多层SENSE-EPI脉冲序列采集,参数为TR/TE = 2000/30 ms,SENSE因子 = 2,翻转角 = 75°,37层轴位切片,标称分辨率 = 3×3×3 mm³,层间距1 mm,16通道神经血管线圈,每次运行采集的动态帧数 = 200。rs-fMRI扫描始终在T1加权扫描之后进行,以便受试者适应扫描仪内的噪声和环境。受试者被要求在 entire 扫描过程中尽可能保持静止并闭眼,未提供其他指示。本数据集旨在为统计学家和影像科学家提供资源,使其能够利用3T下约7分钟常规扫描的数据,量化其图像分析方法的被试内跨会话可重复性。完整数据集可通过NITRC获取。
此处上传了独立成分分析(ICA)得到的聚合图。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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