轻度认知障碍的血浆定量蛋白质组

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/jpost/PXD025945

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

使用多重亲和去除离心柱人14试剂盒（Agilent）从血浆中去除14种主要蛋白质。样品用等体积的三氟乙醇变性，并用二硫苏糖醇还原。游离半胱氨酸残基用碘乙酰胺烷基化。样品与胰蛋白酶孵育，并用C18 ZipTip脱盐。脱盐后的样品在0.1%甲酸（FA）中复水，并使用nanoLC Eksigent 400系统（Eksigent，AB Sciex）与TripleTOF6600质谱仪（AB Sciex）在线联用进行LC-MS分析。肽段分离采用液相色谱法，使用纳升捕集柱（350 μm × 0.5 mm，3 μm，120 Å，AB Sciex）和纳升ChromXP C18反相柱（75 μm × 15 cm，3 μm，120 Å，AB Sciex），以300 nl/min的流速，在0.1% FA中以8-30%乙腈线性梯度洗脱90分钟，然后在0.1% FA中以30%至40%乙腈线性梯度洗脱10分钟。质谱仪在信息依赖性采集（IDA）模式下运行，扫描全谱（400–1500 m/z）250 ms，随后进行最多30次MS/MS扫描（100–1800 m/z，每次50 ms），循环时间为1.8 s。

电荷状态在+2至+5之间且计数超过每秒125次最低阈值的候选离子被分离用于碎裂，并在将这些离子加入排除列表12秒前采集了一张MS/MS谱图。采用滚动碰撞能量，碰撞能量散布为15。质谱仪使用Analyst TF 1.7.1软件程序（AB Sciex）操作。对于数据依赖采集（DDA，SWATH采集），参数设置如下：100毫秒TOF MS扫描，随后是200个可变SWATH窗口，每个窗口在m/z 400–1250范围内累积时间为50毫秒。MS/MS SWATH扫描设置为5 Da窗口，重叠1 Da，覆盖m/z 400–1250，并在质量范围两侧有所变化。总循环时间为9.6秒。使用了滚动碰撞能量（CE）参数脚本，以

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。