PXD015656：C9orf72富含精氨酸二肽重复蛋白破坏importin beta介导的核输入

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD015656

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

核质转运（NCT）的破坏，包括输入蛋白β货物TDP-43的定位异常，是肌萎缩侧索硬化（ALS）的一个标志，包括由C9orf72中六核苷酸重复扩增引起的ALS。然而，其机制仍不清楚。输入蛋白β及其货物衔接蛋白已被证明可与C9orf72来源的含精氨酸二肽重复蛋白（R-DPRs）——多聚甘氨酸-精氨酸（GR）和多聚脯氨酸-精氨酸（PR）——共沉淀，并且在遗传修饰因子筛选中有保护作用。在此，我们表明，R-DPRs与输入蛋白β相互作用，破坏其货物装载，并以可被RNA挽救的方式抑制透化的小鼠神经元和HeLa细胞中的核输入。尽管R-DPRs在该体外系统中诱导广泛的蛋白质聚集，但转运破坏并非由于NCT蛋白隔离，也不是由于对富含苯丙氨酸-甘氨酸（FG）的核孔复合体的阻断。我们的结果支持一种模型：R-DPRs在核膜附近干扰核转运受体。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。